TCGA数据库的基因表达情况分析

TCGA数据库的基因表达情况分析

数据内容

TCGA、GTEX数据库下载的数据内容形式如下:
TCGA数据库的基因表达情况分析_第1张图片

  • A:样品
  • B:表达水平
  • C:样品类型(正常组织和癌组织)
  • D:数据源

乳腺癌的基因表达情况

以乳腺癌为例:

  1. 筛选出TCGA的乳腺癌表达情况
  2. 在PISM软件中新建柱形图图表
  3. 列标题设置为primary(癌组织)和normal(正常组)
  4. 分别复制两组的表达水平
    TCGA数据库的基因表达情况分析_第2张图片
  5. 生成图表,进行T检验
  6. 表格休整
    TCGA数据库的基因表达情况分析_第3张图片

水平有限。如有补充、错误、建议恳请留言!欢迎交流,留言必回。

2019/1/11

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