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GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家

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本次推文是GBD系列的第6篇，我们可以看示例文章中的Fig S1

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第1张图片

通过聚类的方法将各个国家的发病率分为4组，我们可以看下文章里的方法描述部分：

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第2张图片

可以看出这个方法是采用层次聚类分析的方法对发病率的EAPC进行聚类分组，查了相关的R包后，发现factoextra这个R包可以做层次聚类分析，并能做出相应的图形来。我们可以在图S1的基础上增加内容，我们比如可以根据结合发病率和死亡率的EAPC数据进行聚类

首先我们设定工作路径，读取相关的R包，读取原始数据

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第3张图片

 接着，我们获取发病率的EAPC数值

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第4张图片

同样的，我们再计算出死亡率的EAPC数值

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第5张图片

最后我们将两个数据集合并

 随后我们进行聚类并作图

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第6张图片

得到的图形输出如下

GBD数据库——如何找出发病和死亡年增长类似国家_第7张图片

 

大家在AI里调整图形大小，让文字不重叠，根据各组的数据添加相应的图注即可。

大家如果需要上述代码，关注公众号“小明学习室”，回复关键词“GBD”即可下载全部代码。

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