spm mri segmentation：GM,WM,CSF 及DARTEL normalize

spm12

一、segment

volumes->specify ->要分割的.nii文件

一共三个tissue,每个tissue里有一个Native Tissue按顺序：

第一个Native Tissue:Native：Native+Dartel Imported

第二个Native Tissue:Native：Native+Dartel Imported

第三个Native Tissue:Native：Native space

点击运行run

生成文件：

c1*.nii:GM c2*.nii:WM c3*.nii:CSF

rc1*.nii，rc2*.nii:由DARTEL导入GM,WM需要的文件

二、创建模板（DARTEL）

segment->spm->tools->dartel tools->run dartel(creat templates)

images:添加两张图

Images:rc1.nii

Images:rc2.nii

注意右键把segment删除才能运行

生成u_rc1*.nii以及一系列的模板（template_*.nii)

三、normalize to MNI space

Dartel Template:Template_6.nii

select according to->Many subjects

flow fields: u_*.nii

Images: c1*.nii

preserve->preserve amount

Gaussian FWHM:默认 8 8 8 ,自己设置合适的

生成：smwc*.nii