python编程Demo:将dicom图片转换成jpg图片

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
    lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
    newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])    #归一化
    newimg = (newimg*255).astype('uint8')                #将像素值扩展到[0,255]
    cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

    # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
    dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'       #读取dicom文件
    output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
    ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)         #读取dicom文件的相关信息
    img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)      #获取array
    # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
    #类似于 (1,height,width)的形式
    shape = img_array.shape
    img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2]))  #获取array中的height和width
    high = np.max(img_array)
    low = np.min(img_array)
    convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)   #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
    print('FINISHED')

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