Li‘s 核磁共振影像数据处理-6-fsl线性配准介绍

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fsl线性配准介绍

基本概念

标准空间、结构空间、功能空间

空间变换(SpatialTransformations)
类比:在中国,你的名字是张三,大家给你起了个可爱的昵称叫“三狗子”。在美国,大家可能叫你“san”,或者你有一个英文名,叫“Nicholas Zhang”。

自由度
刚体变换(Rigid-Body Transformations)
6个自由度。3转动,3平动。
仿射变换(Affine Transformations)

12个自由度。刚体变换,3缩放,3偏斜(Skews)/剪切(Shears)。
非线性变换(Non-Linear Transformations)
多于12个自由度。

代价函数(Cost Function)
判断配准好坏的标准。
类比:对人的“成功”的评价也是有不同维度的。比如财富值、行政职级、社会声誉度、发表文章的数量、发表文章的影响力等等。不能说哪个标准就是客观的合理的,而应该选择合适的。

fsl flirt中的代价函数
Correlation Ratio(相关比),常用于核磁共振模态之间。
Mutual Information(互信息),常用于不同影像模态之间。
Least Squares(最小二乘法),用于相同模态。
Normalised Correlation(标准化相关),用于相同模态,改变亮度、对比度。
Normalised Mutual Information(标准化互信息),用于不同模态。

插值(Interpolation)
类比:假设我从家到单位步行需要20分钟。那么,步行到达差不多位于家和单位正中间的早餐店需要多少时间呢?
fsl flirt中的插值法
Nearest Neighbour(最近邻),常用于离散化标签影像。
Trilinear(三线性插值),常用,快速,不太准确。
Spline(样条法),较慢,会产生范围外的值。
Sinc

下期预告:fsl线性配准实践。

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