计算机辅助药物设计配体概念,《计算机辅助药物设计》.ppt

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计算机辅助药物设计陈闻天MAX118专属重要资料计算机辅助药物设计的概念目录1计算机辅助药物设计的理论基础2结合自由能的计算3基于配体/puter-aideddrugdesign,CADD)是以药物分子的基础,是新药研究的工具。它依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道以及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其他内源性配体或者天然药物产物的化学特征,设计出合理的药物分子。MAX118专属重要资料Logo计算机辅助药物设计根据对象分类基于受体结构的药物分子设计方法Receptor-baseddrugdesign基于配体(小分子)的药物设计方法Ligand-baseddrugdesign目前设计的机理从结构转变为药效机理的药物设计(ADME)MAX118专属重要资料Logo计算机辅助药物设计的理论基础受体与配体受体(离子通道受体;G-蛋白偶联受体;跨膜激酶活性受体;细胞内受体)药物-受体作用学说占领学说;速率学说;诱导契合学说;二态模型;钥匙锁学说药物-受体相互作用力共价键;非共价键(静电作用;范德华力;疏水作用;氢键;电荷转移作用;螯合作用)MAX118专属重要资料Logo理论计算方法量子力学(薛定谔的方程)方法:双原子微分重叠法MNDO;定域轨道微扰构型相互作用法PCILO分子力学(立场方法,经典牛顿力学)构筑力场,力场软件有AMBER;ECEPP;MM4…不能用于计算电子的特性如电子云密度,HOMO分子动力学(牛顿力学)经典算法:模拟退火算法;模特卡罗方法MAX118专属重要资料Logo结合自由能计算自由能微扰/热力学积分方法线性相互作用能方法打分函数MAX118专属重要资料Logo基于配体/受体的药物计算基于配体的药物计算基于受体的药物计算MAX118专属重要资料Logo基于配体的药物计算定量构效方法关系(QSAR)2D-QSAR3D-QSAR

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