Ubuntu通过python脚本安装FSL

目录

一、下载安装文件

二、安装

三、配置环境变量

四、检查FSL安装情况


一、下载安装文件

    软件安装脚本下载地址:FSL Software Downloads

    填写个人信息,并点开 "FSL software license" 划到最下面点击 "Agree",完成后点击右下角Register,跳转到下一网页

Ubuntu通过python脚本安装FSL_第1张图片

    点击 Download 超链接下载需要的脚本文件

Ubuntu通过python脚本安装FSL_第2张图片

二、安装

    FSL的安装脚本是用Python2写的,新版本的Ubuntu (16以后)在默认情况下没有安装Python2。在终端输入 python,若提示没有相应的命令,则需要先安装Python2,如下:

sudo apt install python

    回车后需要输入密码,并按回车确认。等待Python2安装成功后可开始用下载的.py文件安装FSL。默认安装在 /usr/local 路径中,这需要最高权限,因此在开始安装之前需要用sudo命令,给予管理权限。

sudo su
输入密码:
cd ~/Downloads
python fslinstaller.py

    等待FSL自行安装即可,这一步耗时比较长,过程中需要保证网络通畅,网速慢可能会导致安装失败。有条件的可以考虑,可提高成功率。

    安装完成后,注销并重新登入。

三、配置环境变量

    上述步骤完成后在终端仍然无法打开fsl,此时还需要进行环境变量的配置。在终端输入:

sudo gedit /etc/profile
输入密码

    在打开的文件的最后加入以下内容,保存并关闭文件:

export PATH=$PATH:/usr/local/fsl/bin
export FSLDIR=/usr/local/fsl

    在终端输入:

sudo gedit /etc/bash.bashrc

    在打开的文件的最后加入以下内容,保存并关闭文件:

FSLDIR=/usr/local/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH

四、检查FSL安装情况

    开启一个新的终端,输入 fsl,能够打开 fsl 版面表示安装成功。

    Ubuntu通过python脚本安装FSL_第3张图片 

    如果不能,在终端输入:

source /etc/bash.bashrc

    如果还是不能,尝试重启系统,再尝试一遍。

    能够成功打开 FSL 界面后测试每一个组块是否能够正常使用。

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