生信 执行github上的HTP工具

GitHub - plantdna/htp: Haplotype-tag polymorphisms

下载conda 

完成环境配置 

更新conda

conda update conda

conda update anaconda

conda创建虚拟环境

conda create --name 'name' python=3.8

（删除指令） 

conda remove -n 'name'

之后运行配置文件（带镜像）

pip install -r requirements.txt -i https://pypi.douban.com/simple 

 

 这里一直报错 最后的方法 

直接在pycharm源文件里添加路径解决

服务器下(linux)

安装了python3.8 

vim编辑器下修改环境变量把3.8加入环境变量

WARNING: You are using pip version 19.2.3, however version 22.2.2 is available.
You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command

升级pip   --user？

$ pip3 install --upgrade pip --user

下载依赖

$ pip3 install -r requirements.txt

 

$ pip3 list

 配置成功