偷个懒---一句话调研microbiome

案列：

你想知道某个微生物在既往研究中丰度情况吗？
你筛出来的差异微生物是否和其他研究相矛盾？
你研究的是肥胖，这个和肥胖相关的细菌是否也和癌症相关呢？
我也有这些疑惑，所以给我自己写的一句话~~方便自己方便大家：

函数命名为【microbiomeAnalysor】

想看看健康人，CRC，和IBD患者，属水平的Fusobacterium菌在肠道中的丰度：

查询关键词：

image.png

计算运行过程（没有报错）：

image.png

计算结果（暂时只设计了我想要看的统计图，其他的以后根据需要再加）：

计算到了28个数据集的结果，健康人中丰度最少，CRC中在各个研究中普遍较高，IBD最高！

image.png

还想看看口腔中，牙周炎患者和健康人对比，种水平的，牙龈普林单胞菌Porphyromonas_gingivalis的丰度

image.png

计算运行过程（缺失了64个样本）：

image.png

计算结果：牙周炎中果然丰度高了很多倍

image.png

Over！！！！下班！