Formation of unusual sugars: mechanistic studies and biosynthetic applications

关键词 脱氧糖 生物合成 机理 抗生素 组合生物

摘要:

稀有糖 羟基被H NH2 烷烃链取代

NDP 葡萄糖是前体

参与C-2 C-3 C-4 C-6脱氧糖合成的酶

核苷酸转移酶识别结合底物类似物

糖基转移酶识别多种底物

介绍:

碳水化合物,能量储备,能量供应,生物大分子的前体或者组成部分。其结构多样源于合成砌块的特征: 多羟基,不同的环组成,环构型和构象。并且两个糖之间有两种连接方式:α β。并且,寡糖链除了糖链延伸,还有链的分支和链的扭转,形成多种结构。这些结构可以进一步引入不同的取代基使得结构多种多样,如一个或者多个羟基被氢 氨基 烷烃取代。

碳水化合物的组成严重影响其疏水性,溶解性,大分子的整体拓扑结构,以及影响其和周边的相互作用。很多稀有糖作为细胞间传输的配体,或者作为毒素,抗体或者微生物的靶标。取代基的不同严重影响其化学性质和生物活性。

脂多糖中的稀有糖决定细菌的免疫活性和内毒素的活性,其是一些噬菌体的受体。

脱氧糖,氨基糖,支链糖来自植物和微生物中的次级代谢产物,如黑芥子。。。抗生素 抗癌物质。这些稀有糖对于优化生物活性有重要作用,移除稀有糖会导致生物活性消失。

卡奇霉素: 这个烯二炔对鼠科肿瘤 赘生物 革兰氏阳性菌阴性菌均有良好的生物活性。与卡奇霉素结合可以导致DNA靶标的构型变化,因此阻止转录或者转录激发功能基因。芳基和鼠李糖苷决定卡奇霉素单向结合在DNA的特定区域。移除鼠李糖,会降低DNA的裂解效率。糖b中的硫原子可以和3鸟嘌呤上的氢形成氢键。糖a b形成的糖苷键可以使得卡奇霉素形成一个小沟,小沟结合DNA.

大环内酯抗生素的糖苷对生物活性也非常重要。红霉素结合70S核糖体,降解多肽tRNA,阻止细菌蛋白合成。红霉素结构中的红霉脱氧糖苷如果被单一甲基化,其生物活性降低95%,说明糖的结构非常重要。移除二甲基化的红霉脱氧糖苷导致丧失肠胃收缩能力。红霉素或者其他抗生素中的氨基糖的氨基影响巨噬细胞吸收药物,影响药物传输到感染部位。红霉素2位羟基的酯化减轻肠胃的副作用。

抗生素糖也参与药物抗性机制。阿霉素中氨基糖的氨基是具有药物抗性的肿瘤细胞的的识别位点,识别后转运pgp.另外这个氨基糖的二甲氨基可以被肝脏里面的p450氧化,然后和酶活性中共价结合,影响肝脏对其他药物的代谢。据报道,糖基化的抗生素没有副作用,和很少的毒性。

本文研究稀有糖的生物合成,致力于获得相关的基因,酶学机制。

组合生物化学筛药

C-O键的断裂生成单脱氧 二脱氧 三脱氧 四脱氧糖,C-N键的形成 生成氨基糖,C-C键的形成生成支链糖以及脱氧糖的异构化。定点突变研究核苷酸转移酶。糖基转移酶 序列分析以及底物专一性。

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