医学论文笔记:TMI2021 SMU-Net: Saliency-Guided Morphology-Aware U-Net for Breast Lesion Segmentation ...

乳腺超声分割:

文章指出周围组织(即背景)和病变区域(即前景)之间的模式复杂性和强度相似性给病变分割带来了挑战。考虑到背景中包含如此丰富的纹理信息,很少有方法尝试探索和利用背景显着表示来辅助前景分割。 此外,BUS 图像的其他特征,即 1)低对比度外观和模糊边界,以及 2)病灶形状和位置变化显着,也增加了准确病灶分割的难度。

文中提出了saliency-guided morphology-aware U-Net (SMU-Net)。

Method:

1.Saliency Map Generation:

利用saliency map生成高潜力的显著性区域来引导前景和背景的表征学习。sm合并低维度和高维度图像结构,其中,低维度利用超像素聚类(superpixel clustering),高维度利用区域聚类(region grouping)。

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1) Low-Level Saliency Map:

超像素聚类局部相似像素点,但因为超声影像组织和周围其他区域外观相似,并且病变组织是多变的,简单的聚类很难获得。

选择三个不同簇数,并随机手动选择目标区域中的种子点,对于每张置信度图,选择种子点所在的区域合并。

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2)High-Level Saliency Map:

超像素只局限在局部信息,忽略了物体的整个信息。此外,由于病变的大小差异很大,基于单尺度图像的显着图生成将导致省略相对较小的区域。

使用hierarchical clustering,再聚集,得到multi-scale cluster hierarchy

2.Network Architecture

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1)Main Network and Auxiliary Network: 均为U-Net

2) The Middle Stream: 四个block,每个由 background-assisted fusion, shape-aware, edge-aware and position-aware units组成

a) Background-assisted fusion unit:

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b) Shape-aware unit:

预测图P+形状约束图Y,l_c=mse(P,Y)

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c) Edge-aware unit:

边界信息可以保持目标的完整性和唯一性

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d) Position-aware unit:

位置引导图由原始图片和三个种子点的中心确定

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3. Hybrid Loss Function

主网络loss + middle steam loss + shape-aware loss

前两个用dice+CE。

Datasets and Experimen:

五个数据集+三个交叉验证、另外两个额外验证

Comparison With State-of-the-Art Methods1表+1图

Efficacy of Auxiliary Network and Background-Assisted Fusion Unit:消融实验,一张表

Efficacy of Morphology-Aware Units:消融实验,一张箱状图

Parameter Analysis:(两个图)

a)关于Saliency Map Generation中,种子点数目 + w_l、w_h参数变化率

b)混合loss中超参数

Robustness Analysis:(四个表)

a) Robustness on Benign and Malignant Lesion Segmentation: 恶性比良性难分割,三个数据集在三种B、M比例下的结果

b)Robustness on Lesion Size: 将数据集中不同的大小区分来,看测试结果

c)Robustness on Lesion Shape::按是否为凸形分成常规形状和非常规形状,看测试结果

d) Robustness on Seed Point Position:种子点生成需要简单的用户交互,我们讨论了不同观察者提供的种子点位置对所提方法性能的影响。

Discussion:

A. External Validation:一张表

B.Comparison With Semi-Automatic Interactive Methods:一张图+一张表

C. Comparison With Auto-Context-Based Methods:一张图+一张表

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