github东西无法下载_关于在ubuntu（Linux）下载软件的tips

https://www.pontikis.net/blog/package-management-system-update-ubuntu-desktop Package Management and System Update in Ubuntu Desktop（这个网站上有说一些关于Ubuntu package的基本概念问题）

网站部分截图如下：

一、fastQC在ubuntu中如何更新到最新版本？

https://launchpad.net/ubuntu/+source/fastqc（可以去这个网站看fastQC在ubuntu上的最新版本以及以往发布的版本，界面如下）

终端输入：cat /etc/*release（查看你的ubuntu版本）
         fastqc -version（查看你的fastqc版本）

比如我想更新到0.11.8，那么就在终端运行下列语句：

wget https://launchpad.net/ubuntu/+archive/primary/+files/fastqc_0.11.8+dfsg-1_all.deb
sudo dpkg -i fastqc_0.11.8+dfsg-1_all.deb
sudo apt-get install -f

之后再查看你的版本是否更新完成就好了。更新到最新的版本一般可以解决以下两种比较常见的报错问题：

1、Too many tiles (>500) so giving up trying to do per-tile qualities since we're probably parsing the file wrongly

2、uk.ac.babraham.FastQC.Sequence.SequenceFormatException: Midline 'CTCCTCCCAGCTGGGCTGACEGEH?CEFGdidn't start with '+'

二、如何在ubuntu上下载fastp?

对于fastp的介绍可以参考下面这个链接里面讲的，很清楚，在GitHub上也有相关的内容。 fastp: 一款超快速全功能的FASTQ文件自动化质控+过滤+校正+预处理软件 https://zhuanlan.zhihu.com/p/33601691

但是在下载这个软件包的时候，因为我用的是Linux系统，按照他GitHub上所给的方法在Linux系统上却无法下载，运行完语句后显示没有安装包，找不到fastp。

根据上一篇对于fastQC下载的经验，我去Ubuntu官网找了相关的源链接，

https://launchpad.net/ubuntu/+source/fastp/0.19.5+dfsg-1（编辑的日期是2019.01.08）这会儿最新发布的版本是0.19.5，我本来想找跟上面fastqc类似的command line，但是找了半天没找到，终于，右键点击下面的箭头所指向的文件，复制连接地址，然后粘贴出来就是想要的东西。

http://launchpadlibrarian.net/399141794/fastp_0.19.5+dfsg-1_amd64.deb（复制出来的链接）

终端输入：wget http://launchpadlibrarian.net/399141794/fastp_0.19.5+dfsg-1_amd64.deb
          sudo dpkg -i fastp_0.19.5+dfsg-1_all.deb
          sudo apt-get install -f

安装成功