利用docker容器运行EDTA

个人感觉EDTA是目前注释转座子最好的软件之一了，使用docker可以很方便地使用
而且这个docker容器还集成了repeatmasker和repeatmodeler，可以省去安装这两个软件的麻烦

#以下三行代码可以避免每次使用docker都要加sudo取得root权限的麻烦
sudo groupadd docker
sudo gpasswd -a $USER docker
newgrp docker

#下载EDTA容器
docker pull oushujun/edta:2.0.0


#可以直接运行EDTA
docker run -v $PWD:/in -w /in  oushujun/edta:2.0.0 EDTA.pl
#不过个人更喜欢进入到互动操作模式中使用，可以更灵活
docker run -it -v $PWD:/in -w /in  oushujun/edta:2.0.0