4 篇 NAR | 生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？...

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。

下面再分享7个我们承建发表的数据库，4篇NAR，一篇BIB，一篇Nature protocols，一篇Science Bulletin，一篇iMETA，总计影响因子100+，以飨读者。

中医药方剂的数据库，收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息，

网站古色古香，设计精美，交互探索，网络大气，

高颜值是很好的敲门砖，

于2018年发表于NAR杂志。

（http://www.tcmip.cn/ETCM/）

表格展示太枯燥，关键信息交互式饼图展示，查看，点击筛选~~

现在数据库升级第二版，更多功能，更多展示 （网络图比下面这个更漂亮，更有生物意义，更有交互性，只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o），第三版也在进行投稿中。

另一个是`Prophage hunter`，在细菌基因组中寻找活性噬菌体。

页面极简，但设计精良，定制基因组浏览器交互，

于2019年发表于NAR杂志。（https://pro-hunter.bgi.com/）

表格和基因组浏览器的双向控制

再一个是海洋天然产物数据库，页面精美，功能强大！发表于2020年NAR数据库专刊。（http://www.cmnpd.org）

多模式组合检索

大动物肠道菌群数据库，页面精美，功能强大！发表于2022年NAR数据库专刊。(http://www.ehbio.com/CRAMdb/)

高通量分离培养和鉴定植物根系细菌的在线分析平台于2021年发表于Nature Protocol。

做的更多的还是分子数据的展示，如转录组相关数据的展示，发表于BIB杂志。（www.devomics.cn）

首先展示下首页，专业设计师私人定制，可以传统，可以现代；可以功能为主，也可以轮播酷炫。

• 首页搜索框全局搜索，类似谷歌，输入基因名、通路名、功能关键词皆可搜索。

• 小轮播展示网站可做的分析和结果展示，差异基因富集全套，还是交互式的。

• 四个饼图联动展示数据库收录的样品和属性信息，高端大气显内涵。

那搜索一下，都展示哪些信息？

基因，别名，公共数据库链接，功能注释，表达分布，PPI网络，共表达网络，想放啥放啥！

一个基因嫌少，来绘制一组基因的表达谱，修饰谱；同时展示甲基化修饰与基因表达的关系。

图就不展示了，绝对心中所想！

搜索太简单了（其实功能很强大），可否更多条件搜索？

多组学如何展示？基因组浏览器可否嵌入？

基因组浏览器是多组学的展示利器，更多见：

• IGV基因组浏览器可视化高通量测序数据

• 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 1

• 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 2

• 高通量数据分析必备-基因组浏览器使用介绍 - 3

ChIP类数据同时展示IP, Input样品丰度 （这个双峰图可拆可合）和peak信息，见下图。

展示同源物种，也可以~

更多在线功能，样品聚类、筛选、差异基因（样品特异性基因）、功能富集 （一个小的云平台出来了）

更多交互式图，染色体图谱、饼图、箱线图、交互式表

数据库收录样本信息更多互动展示

这也是一个主页风格，随您定制。

更多地图展示

时间轴变化来一个

访问量统计页来一个 （这是高颜值可定制在线绘图工具-第三版的用户访问，总访问量20万，给您做个友情链接，也能推广带动访问）

以上列出一部分，更多数据库还在建设中，发表后慢慢释放，更多展示和需求也等您提出。

如果您也有建设的需求，欢迎扫码联系我们。

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