什么是正则表达式？
讲真"正则"这个词真的挺抽象，汉语里应该没有这个组合，不知道为什么这样翻译，倒是对应的英文更好理解一些。正则表达式( Regular Expression, RE )是处理字符串的方法，通过一些特殊字符的排列（或者说是模式模板），以行为单位，可以实现查找、删除、替换某特定字符串的功能。好像还是有些不明白，按我的理解来说，正则表达式就像是一张网，用来捕鱼的网，正则表达式中的特殊字符组合就相当于网眼的大小。通过调整字符组合就可以调整网眼尺寸，从而实现捕捉想要捕捉尺寸的鱼，同理，通过正则表达式就可以实现对数据的筛选分流，快速筛选出目标文本(字符，or anything you want)。
为什么要学正则表达式
上篇介绍了两个文本编辑器sed和gawk，在处理文本时用到的命令(模式)就是正则表达式，正则表达式有多丰富，两款工具的功能就有多强大。正则表达式种类很多，其实现需要正则表达式引擎( regular expression engine )，正则表达式引擎是一套底层软件，负责解释正则表达式模式并使用这些模式进行文本匹配。Linux中有两种主流正则表达式引擎：
- 基础正则表达式（ basic regular expression, BRE）引擎
- 扩展正则表达式（ exended regular expression, ERE）引擎
基础正则表达式( BRE )
1. 纯文本
最最基本的BRE模式就是匹配数据流中的文本字符。这部分上篇已经讲过，话不多说，直接看示例：
# sed示例
$ echo "This is a test" | sed -n '/test/p'
This is a test
$
# gawk示例
$ echo "This is a test" | gawk '/test/{print $0}'
This is a test
$
# 需要注意的
正则表达式匹配模式很挑剔，所以匹配的时候会区分大小写；
在正则表达式中，无需写出整个单词，只要定义的文本出现在数据流中，正则表达式就能匹配；
正则表达式中，空格和其他字符并无区别；
2. 锚字符
锁定在行首：脱字符( ^ ) 锁定在行尾：美元符( $ )
比较简单，不多说，看示例就能懂：
# 行首(必须是精确匹配)
$ echo "This is a test" | sed -n '/^This/p'
This is a test
$
# 行尾(必须是精确匹配)
$ echo "This is a test" | sed -n '/test$/p'
This is a test
$
3. 点号字符
点号字符（ . ）属于特殊字符，用来匹配除换行符之外的任意单个字符(必须匹配一个字符，否则模式就不成立)。
还是举例说话：
# 一行一行地看匹配模式
$ cat test.txt
This is a beautiful world.
The cat is sleeping.
That is a very nice hat.
This test is at line four.
at ten o`clock we`ll go home.
$
$ sed -n '/.at/p' test.txt
The cat is sleeping.
That is a very nice hat.
This test is at line four.
$
4. 字符组
如果想要限定待匹配的字符的具体值，点号字符就力不从心了。这个时候需要字符组( character class ), 字符组可以用方括号( [ ] )定义，可在其中写入想要的字符。看示例：
# 这是个极简单的例子，用法其实还有很多，比如连用几个字符组，区间字符(数字)等~
$ sed -n '/[ch]at/p' test.txt
The cat is sleeping.
That is a very nice hat.
$
5. 排除性字符组
顾名思义，跟字符组是相反的，没错，用的特殊字符就是脱字符^，简单到不想多说。
6. 区间
可以说是字符组的一个延伸，比如设置数字匹配模式时，如果想匹配0到9之间的任意数字，可以用下面的方式：
# 常规的字符组表示法
[0123456789]
# 区间表示法，简单很多，起始中间用 "-"
[0-9]
# 以此类推，字母也一样的，比如a-z,A-Z
[a-z], [A-Z]
# 具体用法参照上面字符组即可
7. 特殊字符组
看名称就知道，也是字符组，也算是普通字符组的延伸，不多说，直接摘抄如下：
[[:alpha:]] 匹配任意字母字符，不区分大小写
[[:alnum:]] 匹配任意字母数字字符0-9，a-z,A-Z
[[:blank:]] 匹配空格或制表符
[[:digit:]] 匹配0-9之间的数字
[[:lower:]] 匹配小写字母字符a-z
[[:print:]] 匹配任意可打印字符
[[:punct:]] 匹配标点符号
[[:space:]] 匹配任意空白字符：空格、制表符、NL、FF、VT和CR
[[:upper:]] 匹配任意大写字母字符A-Z
# 同样的，用法参照普通字符组
7. 星号
这里的星号()和Linux命令中的通配符不一样，在正则表达式中，字符后面放置星号表明该字符必须在匹配模式的文本中出现0次或多次*。看示例体会一下：
# 认真体会下最后一个
$ echo "bt" | sed -n '/b[ae]*t/p'
bt
$ echo "bat" | sed -n '/b[ae]*t/p'
bat
$ echo "bet" | sed -n '/b[ae]*t/p'
bet
$ echo "btt" | sed -n '/b[ae]*t/p'
btt
扩展正则表达式( ERE )
正则表达式模式中使用文本字符时，对于一些特殊字符需要格外注意，因为一些字符在正则表达式中是有特别含义的，包括：
. * [] ^ $ {} \ + ? | ()
其中一些字符在基础正则表达式中已经介绍，那扩展正则表达式又扩展在哪里呢？主要是几个只能够被gawk识别，但是sed却无法识别的字符：? + {} | ()
1. 问号
问号与星号作用类似，区别在于问号表明前面的字符可以出现0次或1次(没有其他值)。看示例理解：
# 需要理解所谓的精确匹配，以及方括号的含义
$ echo "bt" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
bt
$ echo "bat" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
bat
$ echo "bot" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
$
$ echo "bet" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
bet
$ echo "baet" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
$
$ echo "beat" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
$
$ echo "beet" | gawk '/b[ae]?t/{print $0}'
$
2. 加号
同于与星号功能类似，同样也有细微区别。加号表示前面字符可以出现1次或多次，且必须至少出现1次。不想举例了~
3. 花括号
跟方括号可以限定具体的匹配字符一样，花括号可以实现正则表达式中对某个模式具体重复次数的限定，有两种形式：
- m：正则表达式准确出现几次
- m,n: 正则表达式至少出现m次，至多n次
比较特殊的是，gawk需要指定 - -re - interval 命令选项才可以识别正则表达式间隔。示例：
$ echo "bt" | gawk --re -interval '/be{1}t/{print $0}'
$ echo "bet" | gawk --re -interval '/be{1}t/{print $0}'
bet
$ echo "bt" | gawk --re -interval '/be{1,2}t/{print $0}'
$ echo "bet" | gawk --re -interval '/be{1,2}t/{print $0}'
bet
4. 管道符号
简单说一句话：管道符表示or(或)的关系，只需满足其中一个即可。示例如下：
$ echo "The cat is asleep" | gawk '/cat|dog/{print $0}'
The cat is asleep
$ echo "The dog is asleep" | gawk '/cat|dog/{print $0}'
The dog is asleep
$ echo "The sheep is asleep" | gawk '/cat|dog/{print $0}'
$
5. 圆括号-表达式分组
圆括号可以实现正则表达式的分组，分组后，每个组会被视为一个标准字符。看示例说话：
# 圆括号里面的字符可视为一个整体
$ echo "Sat" | gawk '/Sat(urday)?/{print $0}'
Sat
$ echo "Saturday" | gawk '/Sat(urday)?/{print $0}'
Saturday
Linux基础部分打算暂且就学这么多先，下一篇开始转录组学数据的实操。