GraphPad数据表学习

1 数据表基本结构:

数据表由列和行组成,在大多数情况下,第一列为X值。其余列为Y值,且这些列可被分为子列,用于输入误差条。

行一般为观测值,重复观测值一般输入同一列,当为分组表时,行是一组分类变量,列是另一组分类变量。

可以对行和列设定标题。

• 对于XY和分组表,重复数据输入到并排子列中。

• 对于列表格,重复数据堆叠到列中。

• 对于嵌套表,重复数据堆叠到子列中。

• 当在列联表、整体部分表、生存表和多变量表中输入数据时,不会输入重复数据值,因此这种区别不相关。

2 各类型数据表认识

2.1 XY数据表

每个点对应一个x和y值,x的重复值录入x列,y的重复值录入y列。创建XY数据表的界面:

一张XY数据表可以包含256个数据集列和多达256个子列。XY数据表对应的分析多为线性或非线性回归,对应的图一般为散点图,对行进行命名后,就可以在XY图上标记各点。

使用XY数据进行的分析

• 非线性回归(曲线拟合)

• 线性回归

• 拟合样条/LOWESS

• 平滑、微分或积分曲线

• 曲线下面积

• Deming(模型II)线性回归

• 相关矩阵

• 相关性XY

• 插入标准曲线

2.1.1 Options选项

2.1.1.1 x为数值型

X:Numbers,Y:Enter and plot a single Y value for each point。x为数值型,y也为数值型,对应的测定值在1列中。示例数据:

成图效果:

2.1.1.2 x为数值型,y有重复测定

X:Numbers,Y:Enter 3 replicate values in side-by-side subcolumns,X为数值型变量,Y的3次重复值放入子列。示例数据:

成图效果:

2.1.1.3 x为数值型,y有计算好的平均值,标准差

X:Numbers,Y:Enter and plot error values already calculated elsewhere,X为数值型变量,y变量的平均值、标准差、样本量分别录入对应列中。示例数据:

成图效果:

2.1.1.4 x为数值型,带误差;y为数值型。

X:Numbers with error values to plot horizontal error bars,输入带误差值的x数据。Y变量为mean。示例数据:

成图效果:

2.1.1.5 x为日期型;y为数值型。

X:Dates,输入日期型x数据。软件会自动识别,并以标准格式(取决于你的软件设置)在表上显示日期。

示例数据:

成图效果:

2.1.1.6 x为时间;y为数值型。

X:Elapsed times,输入时间型x数据。以hh:mm或hh:mm:ss格式输入时间。

示例数据:

成图效果:

2.1.1.7 x不共享数据。

输入x不共享的数据。每个y值对应一个x值,当每组Y值有不同的X值时,可以通过错开输入的方式实现数据一一对应。

示例数据:

成图效果:

2.2 列表

每列是一个组。

示例数据:

2.2.1 Options选项

2.2.1.1 单分组

Enter replicate values, stacked into columns。所有重复测定值录入1列,每1列是1个分组。示例数据:

成图效果:

2.2.1.2 配对或重复测定

Enter paired or repeated measures data-each subject on a separate row. 当有两个分组时,列来控制1个分组,行来控制另1个分组。示例数据:

成图效果:

2.2.1.3 已算好平均值和误差值

Enter and plot error values already calculated elsewhere。已经算好平均值和误差值可以采用这种表格。示例数据:

成图效果:

使用列数据进行的分析

•非配对t检验

•配对t检验。

•比率——配对t检验

•Mann-Whitney检验

•Wilcoxon检验

•Kolmogorov-Smirnov检验

•普通单因素方差分析

•Brown-Forsythe和Welch方差分析

•RM单因素方差分析

•Kruskal-Wallis检验

•Friedman检验

•单样本t检验和Wilcoxon检验

•描述性统计

•正态性检验和Lognormality检验

•频数分布

•ROC曲线

•Bland-Altman

•识别异常值

•分析一堆P值

使用列数据绘制的图形

•条形图

•箱线图

•小提琴图

•带点折线图

2.3 分组列表

行通过一个分组变量对数据进行分类,列通过另一分组变量对数据进行分类。

示例数据结构:

2.3.1 y为单变量

Enter and plot a single Y value for each point.示例数据:

成图效果:

2.3.2 重复测定值录入子列

Enter n replicate values in side-by-side subcolumns示例数据:

成图效果:

2.3.3 已算好均值和误差值

Enter and plot error values already calculated elsewhere.录入已算好误差的数据。

示例数据:

成图效果:

使用分组数据执行的分析

•双因素方差分析(和混合模型)

•三因素方差分析(和混合模型)

•行表示带SD或SEM

•多项t检验 - 每行一项

2.4 列联表

示例数据:

成图效果:

根据列联表进行的分析

•卡方检验和Fisher精确检验(此外,还计算优势比和相对风险)

•占总数的比例

2.5 生存表

医学分析,这里不作学习。

使用生存数据进行分析

•Kaplan-Meier

•对数秩检验

•Wilcoxon-Gehan检验

2.6 整体部分表

示例数据:

成图效果:

对整体部分进行的分析

•占总数的比例

•卡方检验拟合优度(比较所观察的分布与理论分布)

2.7 多变量表

示例数据:

成图效果:

对多变量数据执行的分析

•相关矩阵

•多元线性回归

•提取部分数据并重新排列到新表格中

•变换和选择

•识别异常值

•描述性统计

2.8 嵌套表

示例数据:

成图效果:

基于嵌套表执行的分析

•嵌套t检验

•嵌套单因素方差分析

•描述性统计(每个子列的单独结果)

•正态性(和对数正态性)检验(每个子列的单独结果)

•异常值检验(每个子列的单独结果)

•单样本t检验(每个子列的单独结果)

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