R语言分析微生物组数据代码示例大全

写完这篇推荐信小编可以回家放心过年了，不，是回家生儿育女颐养天年。本文推荐的几款微生物组（扩增子、宏基因组）的数据分析示例网站（pipeline、workshop）进一步降低了该领域数据分析的门槛，把入场券的价格拉到了新的低度。另一方面也让R语言的入门变得更加容易，这是生信小白的福音。，也是目前靠这玩意吃饭者的噩耗！

这几个网站不仅给出我们苦苦寻找的分析R代码，同样重要的是他们还都给出方便易得的示例数据。只要你一步一步复制粘贴代码就可以完成微生物组的数据分析了：多样性分析、差异检验、聚类分析、排序分析、构建进化树、网络图、统计模型的构建。。。这些东西只要是你想到的，不管是统计还是可视化下面的网站都给出了具体的示例（Code && Data）。

2018年是微生物组数据分析的一个里程碑的年份，它终于在这一年从Nature、Science这样的牛期刊中经过各博客、公众号的消化转载出落一个发育完全的美人胚子。杨家有女初长成，端坐在你的面前。分析工具的成熟，分析流程的标准化（标志事件是这本书的出版），给微生物组研究带来了新的生机。当然它也到了寻找新的方向的时节，每一个研究者终于不再圄于分析工具，解放出来的精力可以做更多有意义的事情，比如周末陪陪孩子。

点击标题获得你喜欢的Example analysis：

Analysis of Microbiome Community Data in R

Introduction to the microbiome R package

Microbiota analysis in R, UCR Workshop 2018

Statistical Analysis of Microbiome Data with R

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