2020-06-18 aspera 下载 SRA数据,非常简单!!!

Aspera 安装

  1. 安装aspera
    1. https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list
  2. 选合适自己的操作系统的版本下载:
  3. 下面以Linux系统为例示范安装:
tar zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar.gz
bash ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.sh
###查看一下有没有安装上
ls ~/.aspera  ###如果没有报错就安装好了

安装 ena-fast-download.py

  1. 去github clone仓库git clone https://github.com/wwood/ena-fast-download
  2. 注意这个代码的依赖,确保你把下面三个软件都安装好!
    1. python3
    2. curl
    3. aspera

使用:下载ERR1739691的正向和反向数据(这个是参考代码仓库里面的案例的)

  1. Linux: ./ena-fast-download.py ERR1739691
  2. OSX: ./ena-fast-download.py ERR1739691 --ssh_key osx

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