samtools: 安装

安装samtools

1. 方法一

使用anaconda安装

Note : 使用 anaconda 安装的 samtools 不能使用 tview 功能

2. 方法二

手动下载安装

  1. 在 https://github.com/samtools/samtools 中下载 samtools的相应版本.tar.bz2文件
    wget https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.14/samtools-1.14.tar.bz2
  1. 将下载的.tar.bz2文件进行解压缩,会生成相应名称的目录
    tar -jxvf samtools-1.14.tar.bz2
    生成目录
  1. 进入新生成的目录进行安装,这里注意使用解压后生成目录的绝对路径
    ./configure --prefix=/home/zhiyong/Application/samtools-1.14
  1. 进行编译
    make
    make install
  1. 命令全局化
    方法一:把samtools文件的绝对路径添加至系统路径
    方法二:在 /usr/local/bin 目录下建立 samtools 文件的软链接

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