conda安装Hic-Pro

关于在服务器集群上，非root用户如何使用conda安装Hic-Pro.

首先，要先安装有合适的安装包，去到 https://github.com/nservant/HiC-Pro 右侧 https://github.com/nservant/HiC-Pro/releases 可以提供更多版本。

可以直接下载通过:

git clone https://github.com/nservant/HiC-Pro.git

此时无需解压缩可直接进入

cd HiC-Pro/

此时需要先进行conda环境的构建，虽然Github上作者建议使用miniconda，实际上anaconda2/3都可以，笔者使用的是anaconda2版本，

conda env create -f MY_INSTALL_PATH/HiC-Pro/environment.yml -p WHERE_TO_INSTALL_MY_ENV -n Name

注意:在这里应该加入-n选项方便后续激活conda环境。

安装成功以后即可进入conda环境

conda activate Name

进入环境后，找到MY_INSTALL_PATH/HiC-Pro/ 文件夹下config-install.txt

vim config-install.txt 按照需要的条目填写绝对路径，最后一行表示提交任务系统，可以搜索合适的填写。注意:一定要在打开conda环境下使用 which，例如，which R；

填写完毕后，保存config-install.txt，返回

make configure

make