目录
1、Pytorch读取数据流程
2、DataLoader参数
3、DataLoader,Sampler和Dataset
4、sampler和batch_sampler
5、源码解析
6、RandomSampler(dataset)、 SequentialSampler(dataset)
7、BatchSampler(Sampler)
8、总结
9、自定义Sampler和BatchSampler
研究一下dataset是怎样产生的,有了dataset类,才能创建DataLoader对象。
Pytorch读取数据虽然特别灵活,但是还是具有特定的流程的,它的操作顺序为:
Dataset
不能够满足需求,我们也可以自定义 Dataset
,通过继承 torch.utils.data.Dataset
。在继承的时候,需要 override
三个方法。
__init__
: 用来初始化数据集;__getitem__
:给定索引值,返回该索引值对应的数据;它是python built-in方法,其主要作用是能让该类可以像list一样通过索引值对数据进行访问;__len__
:用于len(Dataset)
时能够返回大小;本篇文章的侧重点在于介绍 DataLoader,因此对于自定义 Dataset,这里不作详细的说明。
先介绍一下DataLoader(object)的参数:
collate_fn
是将img和label分别合并成imgs和labels,所以如果你的__getitem__
方法只是返回 img, label
,那么你可以使用默认的collate_fn
方法,但是如果你每次读取的数据有img, box, label
等等,那么你就需要自定义collate_fn
来将对应的数据合并成一个batch数据,这样方便后续的训练步骤。这里,我们需要重点关注sampler
和batch_sampler
这两个参数。在介绍这两个参数之前,我们需要首先了解一下DataLoader,Sampler和Dataset三者关系。
在介绍该参数之前,我们首先需要知道DataLoader,Sampler和Dataset三者关系。首先我们看一下DataLoader.next的源代码长什么样,为方便理解我只选取了num_works为0的情况(num_works简单理解就是能够并行化地读取数据)。
class DataLoader(object):
...
def __next__(self):
if self.num_workers == 0:
indices = next(self.sample_iter) # Sampler
batch = self.collate_fn([self.dataset[i] for i in indices]) # Dataset
if self.pin_memory:
batch = _utils.pin_memory.pin_memory_batch(batch)
return batch
在阅读上面代码前,我们可以假设我们的数据是一组图像,每一张图像对应一个index,那么如果我们要读取数据就只需要对应的index即可,即上面代码中的indices
,而选取index的方式有多种,有按顺序的,也有乱序的,所以这个工作需要Sampler
完成,现在你不需要具体的细节,后面会介绍,你只需要知道DataLoader和Sampler在这里产生关系。
那么Dataset和DataLoader在什么时候产生关系呢?没错就是下面一行。我们已经拿到了indices,那么下一步我们只需要根据index对数据进行读取即可了。
再下面的if
语句的作用简单理解就是,如果pin_memory=True
,那么Pytorch会采取一系列操作把数据拷贝到GPU,总之就是为了加速。
综上可以知道DataLoader,Sampler和Dataset三者关系如下:
通过上面对DataLoader参数的介绍,发现参数里面有两种sampler:sampler
和batch_sampler
,都默认为None
。前者的作用是生成一系列的index,而batch_sampler则是将sampler生成的indices打包分组,得到一个又一个batch的index。例如下面示例中,BatchSampler
将SequentialSampler
(Sampler的一种)生成的index按照指定的batch size分组。
from torch.utils.data import SequentialSampler, BatchSampler
SequentialSampler(range(10))
Out[5]:
list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False))
Out[6]: [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9]]
a = BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False)
b = iter(a)
next(b)
Out[9]: [0, 1, 2]
next(b)
Out[10]: [3, 4, 5]
b = iter(a)
next(b)
Out[12]: [0, 1, 2]
从这个例子中可以看出,当BatchSampler
中的数据取完了,再使用iter(a)
得到新的迭代器对象即可,不需要再次实例化类。
Pytorch中已经实现的Sampler
有如下几种(均在torch.utils.data
下):
SequentialSampler
(若shuffle=False
,则若未指定sampler,默认使用)RandomSampler
(若shuffle=True
,则若未指定sampler,默认使用)WeightedSampler
SubsetRandomSampler
Pytorch中已经实现的 batch_sampler
为BatchSampler
(在torch.utils.data
下,默认使用)
需要注意的是DataLoader的部分初始化参数之间存在互斥关系,这个你可以通过阅读源码更深地理解,这里只做总结:
batch_sampler
,那么这些参数都必须使用默认值:batch_size
, shuffle
,sampler
,drop_last
sampler
,那么shuffle
需要设置为False
sampler
和batch_sampler
都为None
,那么batch_sampler
使用Pytorch已经实现好的BatchSampler
,而sampler
分两种情况:
shuffle=True
,则sampler=RandomSampler(dataset)
shuffle=False
,则sampler=SequentialSampler(dataset)
首先,大概扫一下DataLoader
的代码:
class DataLoader(object):
__initialized = False
def __init__(self, dataset, batch_size=1, shuffle=False, sampler=None, batch_sampler=None,
num_workers=0, collate_fn=default_collate, pin_memory=False, drop_last=False,
timeout=0, worker_init_fn=None):
self.dataset = dataset
self.batch_size = batch_size
self.num_workers = num_workers
...
if sampler is not None and shuffle:
raise ValueError('sampler option is mutually exclusive with "shuffle"')
...
if batch_sampler is None:
if sampler is None:
if shuffle:
sampler = RandomSampler(dataset)
else:
sampler = SequentialSampler(dataset)
batch_sampler = BatchSampler(sampler, batch_size, drop_last)
self.sampler = sampler
self.batch_sampler = batch_sampler
self.__initialized = True
...
def __iter__(self):
return _DataLoaderIter(self)
...
这里我们主要看__init__()
和__iter__()
:
(1)数据的shuffle和batch处理
(2)因为DataLoader只有__iter__()
而没有实现__next__()
所以DataLoader是一个iterable而不是iterator。这个iterator的实现在_DataLoaderIter
中。
iterable:可迭代的;iterator:迭代器
这两个类的实现是在dataloader.py
的同级目录下的torch/utils/data/sampler.py
sampler.py
中实现了一个父类Sampler,以及SequentialSampler,RandomSampler和BatchSampler等五个继承Sampler的子类
这里面的Sampler的实现是用C/C++实现的,这里的细节暂且不表。
我们这里需要知道的是:对每个采样器,都需提供__iter__
方法和__len__
方法,其中__iter__
方法用以表示数据遍历的方式,__len__
方法用以返回数据的长度。
import torch
class Sampler(object):
r"""Base class for all Samplers.
Every Sampler subclass has to provide an __iter__ method, providing a way
to iterate over indices of dataset elements, and a __len__ method that
returns the length of the returned iterators.
"""
def __init__(self, data_source):
pass
def __iter__(self):
raise NotImplementedError
def __len__(self):
raise NotImplementedError
class SequentialSampler(Sampler):
r"""Samples elements sequentially, always in the same order.
Arguments:
data_source (Dataset): dataset to sample from
"""
def __init__(self, data_source):
self.data_source = data_source
def __iter__(self):
return iter(range(len(self.data_source)))
def __len__(self):
return len(self.data_source)
class RandomSampler(Sampler):
r"""Samples elements randomly, without replacement.
Arguments:
data_source (Dataset): dataset to sample from
"""
def __init__(self, data_source):
self.data_source = data_source
def __iter__(self):
return iter(torch.randperm(len(self.data_source)).tolist())
def __len__(self):
return len(self.data_source)
if __name__ == "__main__":
print(list(RandomSampler(range(10))))
print(list(SequentialSampler(range(10))))
a = SequentialSampler(range(10))
from collections import Iterable
print(isinstance(a, Iterable))
from collections import Iterator
print(isinstance(a, Iterator))
for x in SequentialSampler(range(10)):
print(x)
print(next(a))
print(next(iter(a)))
输出结果为:
[3, 7, 5, 8, 9, 0, 2, 4, 1, 6]
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
True
False
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
TypeError: 'SequentialSampler' object is not an iterator
0
可以看出RandomSampler
等方法返回的就是DataSet
中的索引位置(indices),其中,在子类中的__iter__
方法中,需要返回的是iter(xxx)
(即iterator)的形式:
#### 以下两个代码是等价的
for data in dataloader:
...
#### 等价与
iters = iter(dataloader)
while 1:
try:
next(iters)
except StopIteration:
break
此外,torch.randperm()
的用法如下:
最后,我们再理解一下这些类中间的__iter__
函数,该函数的返回值为迭代器对象,可以使用for循环或者next()
函数依次访问该迭代器对象中的每一个元素。但是这些类是可迭代类并不是迭代器类,所以上例中的实例对象a
只能使用for循环访问__iter__
函数返回的迭代器对象,而不能直接使用next()
函数,需要使用iter()
函数得到__iter__
函数返回的迭代器对象。如下所示,可以看到iter(a)
后得到的结果为range_iterator
,也就是__iter__
函数返回的迭代器对象。
a
Out[74]: <__main__.SequentialSampler at 0x7fa26c1d7898>
iter(a)
Out[75]:
BatchSampler
是wrap一个sampler,并生成mini-batch的索引(indices)的方式。代码如下所示:
class BatchSampler(Sampler):
r"""Wraps another sampler to yield a mini-batch of indices.
Args:
sampler (Sampler): Base sampler.
batch_size (int): Size of mini-batch.
drop_last (bool): If ``True``, the sampler will drop the last batch if
its size would be less than ``batch_size``
Example:
>>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False))
[[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9]]
>>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=True))
[[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]]
"""
def __init__(self, sampler, batch_size, drop_last):
if not isinstance(sampler, Sampler):
raise ValueError("sampler should be an instance of "
"torch.utils.data.Sampler, but got sampler={}"
.format(sampler))
if not isinstance(batch_size, _int_classes) or isinstance(batch_size, bool) or \
batch_size <= 0:
raise ValueError("batch_size should be a positive integeral value, "
"but got batch_size={}".format(batch_size))
if not isinstance(drop_last, bool):
raise ValueError("drop_last should be a boolean value, but got "
"drop_last={}".format(drop_last))
self.sampler = sampler
self.batch_size = batch_size
self.drop_last = drop_last
def __iter__(self):
batch = []
# 一旦达到batch_size的长度,说明batch被填满,就可以yield出去了
for idx in self.sampler:
batch.append(idx)
if len(batch) == self.batch_size:
yield batch
batch = []
if len(batch) > 0 and not self.drop_last:
yield batch
def __len__(self):
# 比如epoch有100个样本,batch_size选择为64,那么drop_last的结果为1,不drop_last的结果为2
if self.drop_last:
return len(self.sampler) // self.batch_size
else:
return (len(self.sampler) + self.batch_size - 1) // self.batch_size
if __name__ == "__main__":
print(list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False)))
# [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9]]
print(list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=True)))
# [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]]
这里主要看__iter__
方法,可以看到,代码的思路很清楚明白的展示了batch indices
的是如何取出的。要想理解该方法,最重要的是对于yield
关键字的理解。之前我已经有一篇文章解释过yield
关键字了。这里只说结论:yield
就是return
返回一个值,并且记住这个返回的位置,下次迭代就从这个位置后开始;同时包含yield
的函数为生成器(生成器是迭代器对象),当直接调用该函数的时候,会返回一个生成器。而生成器是迭代器对象,正好对应于前面所述的Sample对象的__iter__(self)
函数,返回值需要是迭代器对象。
对于BatchSampler
类而言,只含有__iter__
含义,但是不含有__next__
函数,所以它是一个可迭代类但是不是一个迭代器类。因此只能使用for循环,不能使用next()
函数。若想使用next()
函数,需要使用iter()
函数作用于BatchSampler
类的实例,这样就可以得到__iter__
函数的返回值即迭代器对象。其实对于含有__iter__
的类,使用for循环遍历其数据的时候,内部是内置了__iter__
函数了。
假设某个数据集有100个样本,batch size=4
时,以SequentialSampler
和BatchSampler
为例,Pytorch读取数据的时候,主要过程是这样的:
SequentialSampler
类中的__iter__
方法返回iter(range(100))
迭代器对象,对其进行遍历时,会依次得到range(100)
中的每一个值,也就是100个样本的下标索引。BatchSampler
类中__iter__
使用for循环访问SequentialSampler
类中的__iter__
方法返回的迭代器对象,也就是iter(range(100))
。当达到batch size大小的时候,就使用yield方法返回。而含有yield方法为生成器也是一个迭代器对象,因此BatchSampler
类中__iter__
方法返回的也是一个迭代器对象,对其进行遍历时,会依次得到batch size大小的样本的下标索引。DataLoaderIter
类会依次遍历类中的BatchSampler
类中__iter__
方法返回的迭代器对象,得到每个batch的数据下标索引。class Sampler(object):
r"""Base class for all Samplers.
Every Sampler subclass has to provide an :meth:`__iter__` method, providing a
way to iterate over indices of dataset elements, and a :meth:`__len__` method
that returns the length of the returned iterators.
.. note:: The :meth:`__len__` method isn't strictly required by
:class:`~torch.utils.data.DataLoader`, but is expected in any
calculation involving the length of a :class:`~torch.utils.data.DataLoader`.
"""
def __init__(self, data_source):
pass
def __iter__(self):
raise NotImplementedError
def __len__(self):
return len(self.data_source)
所以你要做的就是定义好__iter__(self)
函数,不过要注意的是该函数的返回值需要是迭代器对象。例如SequentialSampler
返回的是iter(range(len(self.data_source)))
。
另外BatchSampler
与其他Sampler
的主要区别是它需要将Sampler作为参数,打包Sampler中__iter__
方法返回的迭代器对象的迭代值,进而每次迭代返回以batch size为大小的index列表。也就是说在后面的读取数据过程中使用的都是batch sampler
。