Spark调优

常规性能调优

1. 最优资源配置

Spark性能调优的第一步,就是为任务分配更多的资源,在一定范围内,增加资源的分配与性能的提升是成正比的,实现了最优的资源配置后,在此基础上再考虑进行后面论述的性能调优策略。资源的分配在使用脚本提交Spark任务时进行指定。

名称 说明
--num-executors 配置Executor的数量
--driver-memory 配置Driver内存(影响不大)
--executor-memory 配置每个Executor的内存大小
--executor-cores 配置每个Executor的CPU core数量
配置 配置作用
增加Executor·个数 在资源允许的情况下,增加Executor的个数可以提高执行,task的并行度。比如有4个Executor,每个Executor有2个CPU core,那么可以并行执行8个task,如果将Executor的个数增加到8个(资源允许的情况下),那么可以并行执行16个task,此时的并行能力提升了一倍
增加每个Executor的CPU core个数 在资源允许的情况下,增加每个Executor的Cpu core个数,可以提高执行task的并行度。比如有4个Executor,每个Executor有2个CPU core,那么可以并行执行8个task,如果将每个Executor的CPU core个数增加到4个(资源允许的情况下),那么可以并行执行16个task,此时的并行能力提升了一倍
增加每个Executor的内存量 在资源允许的情况下,增加每个Executor的内存量以后,对性能的提升有三点: 1. 可以缓存更多的数据(即对RDD进行cache),写入磁盘的数据相应减少,甚至可以不写入磁盘,减少了可能的磁盘IO;2. 可以为shuffle操作提供更多内存,即有更多空间来存放reduce端拉取的数据,写入磁盘的数据相应减少,甚至可以不写入磁盘,减少了可能的磁盘IO;3. 可以为task的执行提供更多内存,在task的执行过程中可能创建很多对象,内存较小时会引发频繁的GC,增加内存后,可以避免频繁的GC,提升整体性能

例如:

/usr/local/spark/bin/spark-submit \
--class com.atguigu.spark.WordCount \
--num-executors 80 \
--driver-memory 6g \
--executor-memory 6g \
--executor-cores 3 \
--master yarn-cluster \
--queue root.default \
--conf spark.yarn.executor.memoryOverhead=2048 \
--conf spark.core.connection.ack.wait.timeout=300 \
/usr/local/spark/spark.jar

参数配置参考值:
--num-executors:50~100
--driver-memory:1G~5G
--executor-memory:6G~10G
--executor-cores:3
--master:实际生产环境一般使用yarn-cluster

2. RDD优化

  • RDD持久化

在Spark中,当多次对同一个RDD执行算子操作时,每一次都会对这个RDD以之前的父RDD重新计算一次,这种情况是必须要避免的,对同一个RDD的重复计算是对资源的极大浪费,因此,必须对多次使用的RDD进行持久化,通过持久化将公共RDD的数据缓存到内存/磁盘中,之后对于公共RDD的计算都会从内存/磁盘中直接获取RDD数据。

对于RDD的持久化,有两点需要说明:
第一,RDD的持久化是可以进行序列化的,当内存无法将RDD的数据完整的进行存放的时候,可以考虑使用序列化的方式减小数据体积,将数据完整存储在内存中。
第二,如果对于数据的可靠性要求很高,并且内存充足,可以使用副本机制,对RDD数据进行持久化。当持久化启用了复本机制时,对于持久化的每个数据单元都存储一个副本,放在其他节点上面,由此实现数据的容错,一旦一个副本数据丢失,不需要重新计算,还可以使用另外一个副本

  • RDD尽可能早的filter操作

获取到初始RDD后,应该考虑尽早地过滤掉不需要的数据,进而减少对内存的占用,从而提升Spark作业的运行效率

3. 并行度调节

Spark作业中的并行度指各个stage的task的数量。
如果并行度设置不合理而导致并行度过低,会导致资源的极大浪费,例如,20个Executor,每个Executor分配3个CPU core,而Spark作业有40个task,这样每个Executor分配到的task个数是2个,这就使得每个Executor有一个CPU core空闲,导致资源的浪费。

理想的并行度设置,应该是让并行度与资源相匹配,简单来说就是在资源允许的前提下,并行度要设置的尽可能大,达到可以充分利用集群资源。合理的设置并行度,可以提升整个Spark作业的性能和运行速度。

Spark官方推荐,task数量应该设置为Spark作业总CPU core数量的2~3倍。之所以没有推荐task数量与CPU core总数相等,是因为task的执行时间不同,有的task执行速度快而有的task执行速度慢,如果task数量与CPU core总数相等,那么执行快的task执行完成后,会出现CPU core空闲的情况。如果task数量设置为CPU core总数的2~3倍,那么一个task执行完毕后,CPU core会立刻执行下一个task,降低了资源的浪费,同时提升了Spark作业运行的效率。

Spark作业并行度的设置:

val conf = new SparkConf().set("spark.default.parallelism", "500")

4. 广播大变量

默认情况下,task中的算子中如果使用了外部的变量,每个task都会获取一份变量的复本,这就造成了内存的极大消耗。一方面,如果后续对RDD进行持久化,可能就无法将RDD数据存入内存,只能写入磁盘,磁盘IO将会严重消耗性能;另一方面,task在创建对象的时候,也许会发现堆内存无法存放新创建的对象,这就会导致频繁的GC,GC会导致工作线程停止,进而导致Spark暂停工作一段时间,严重影响Spark性能。

假设当前任务配置了20个Executor,指定500个task,有一个20M的变量被所有task共用,此时会在500个task中产生500个副本,耗费集群10G的内存,如果使用了广播变量, 那么每个Executor保存一个副本,一共消耗400M内存,内存消耗减少了5倍。

广播变量在每个Executor保存一个副本,此Executor的所有task共用此广播变量,这让变量产生的副本数量大大减少。

在初始阶段,广播变量只在Driver中有一份副本。task在运行的时候,想要使用广播变量中的数据,此时首先会在自己本地的Executor对应的BlockManager中尝试获取变量,如果本地没有,BlockManager就会从Driver或者其他节点的BlockManager上远程拉取变量的复本,并由本地的BlockManager进行管理;之后此Executor的所有task都会直接从本地的BlockManager中获取变量。

5. Kryo序列化

默认情况下,Spark使用Java的序列化机制。Java的序列化机制使用方便,不需要额外的配置,在算子中使用的变量实现Serializable接口即可,但是,Java序列化机制的效率不高,序列化速度慢并且序列化后的数据所占用的空间依然较大。

Kryo序列化机制比Java序列化机制性能提高10倍左右,Spark之所以没有默认使用Kryo作为序列化类库,是因为它不支持所有对象的序列化,同时Kryo需要用户在使用前注册需要序列化的类型,不够方便,但从Spark 2.0.0版本开始,简单类型、简单类型数组、字符串类型的Shuffling RDDs 已经默认使用Kryo序列化方式了。

配置Kryo序列化:

//创建SparkConf对象
val conf = new SparkConf().setMaster(…).setAppName(…)
//使用Kryo序列化库,如果要使用Java序列化库,需要把该行屏蔽掉
conf.set("spark.serializer", "org.apache.spark.serializer.KryoSerializer");  
//在Kryo序列化库中注册自定义的类集合,如果要使用Java序列化库,需要把该行屏蔽掉
conf.set("spark.kryo.registrator", "atguigu.com.MyKryoRegistrator"); 

5. 调节本地化等待时长

Spark作业运行过程中,Driver会对每一个stage的task进行分配。根据Spark的task分配算法,Spark希望task能够运行在它要计算的数据算在的节点(数据本地化思想),这样就可以避免数据的网络传输。通常来说,task可能不会被分配到它处理的数据所在的节点,因为这些节点可用的资源可能已经用尽,此时,Spark会等待一段时间,默认3s,如果等待指定时间后仍然无法在指定节点运行,那么会自动降级,尝试将task分配到比较差的本地化级别所对应的节点上,比如将task分配到离它要计算的数据比较近的一个节点,然后进行计算,如果当前级别仍然不行,那么继续降级。

当task要处理的数据不在task所在节点上时,会发生数据的传输。task会通过所在节点的BlockManager获取数据,BlockManager发现数据不在本地时,户通过网络传输组件从数据所在节点的BlockManager处获取数据。

网络传输数据的情况是我们不愿意看到的,大量的网络传输会严重影响性能,因此,我们希望通过调节本地化等待时长,如果在等待时长这段时间内,目标节点处理完成了一部分task,那么当前的task将有机会得到执行,这样就能够改善Spark作业的整体性能。

Spark的本地化等级如下:

名称 解析
PROCESS_LOCAL 进程本地化,task和数据在同一个Executor中,性能最好。
NODE_LOCAL 节点本地化,task和数据在同一个节点中,但是task和数据不在同一个Executor中,数据需要在进程间进行传输。
RACK_LOCAL 机架本地化,task和数据在同一个机架的两个节点上,数据需要通过网络在节点之间进行传输。
NO_PREF 对于task来说,从哪里获取都一样,没有好坏之分。
ANY task和数据可以在集群的任何地方,而且不在一个机架中,性能最差。

在Spark项目开发阶段,可以使用client模式对程序进行测试,此时,可以在本地看到比较全的日志信息,日志信息中有明确的task数据本地化的级别,如果大部分都是PROCESS_LOCAL,那么就无需进行调节,但是如果发现很多的级别都是NODE_LOCAL、ANY,那么需要对本地化的等待时长进行调节,通过延长本地化等待时长,看看task的本地化级别有没有提升,并观察Spark作业的运行时间有没有缩短。

注意,不要将本地化等待时长延长地过长,导致因为大量的等待时长,使得Spark作业的运行时间反而增加了。

算子调优

1. mapPartitions

普通的map算子对RDD中的每一个元素进行操作,而mapPartitions算子对RDD中每一个分区进行操作。如果是普通的map算子,假设一个partition有1万条数据,那么map算子中的function要执行1万次,也就是对每个元素进行操作。

如果是mapPartition算子,由于一个task处理一个RDD的partition,那么一个task只会执行一次function,function一次接收所有的partition数据,效率比较高。

比如,当要把RDD中的所有数据通过JDBC写入数据,如果使用map算子,那么需要对RDD中的每一个元素都创建一个数据库连接,这样对资源的消耗很大,如果使用mapPartitions算子,那么针对一个分区的数据,只需要建立一个数据库连接。

mapPartitions算子也存在一些缺点:对于普通的map操作,一次处理一条数据,如果在处理了2000条数据后内存不足,那么可以将已经处理完的2000条数据从内存中垃圾回收掉;但是如果使用mapPartitions算子,但数据量非常大时,function一次处理一个分区的数据,如果一旦内存不足,此时无法回收内存,就可能会OOM,即内存溢出。

因此,mapPartitions算子适用于数据量不是特别大的时候,此时使用mapPartitions算子对性能的提升效果还是不错的。(当数据量很大的时候,一旦使用mapPartitions算子,就会直接OOM)
在项目中,应该首先估算一下RDD的数据量、每个partition的数据量,以及分配给每个Executor的内存资源,如果资源允许,可以考虑使用mapPartitions算子代替map。

2. foreachPartition优化数据库操作

在生产环境中,通常使用foreachPartition算子来完成数据库的写入,通过foreachPartition算子的特性,可以优化写数据库的性能。

如果使用foreach算子完成数据库的操作,由于foreach算子是遍历RDD的每条数据,因此,每条数据都会建立一个数据库连接,这是对资源的极大浪费,因此,对于写数据库操作,我们应当使用foreachPartition算子。

与mapPartitions算子非常相似,foreachPartition是将RDD的每个分区作为遍历对象,一次处理一个分区的数据,也就是说,如果涉及数据库的相关操作,一个分区的数据只需要创建一次数据库连接。

使用了foreachPartition算子后,可以获得以下的性能提升:

  1. 对于我们写的function函数,一次处理一整个分区的数据;
  2. 对于一个分区内的数据,创建唯一的数据库连接;
  3. 只需要向数据库发送一次SQL语句和多组参数;

在生产环境中,全部都会使用foreachPartition算子完成数据库操作。foreachPartition算子存在一个问题,与mapPartitions算子类似,如果一个分区的数据量特别大,可能会造成OOM,即内存溢出。

3. filter与coalesce的配合使用

在Spark任务中我们经常会使用filter算子完成RDD中数据的过滤,在任务初始阶段,从各个分区中加载到的数据量是相近的,但是一旦进过filter过滤后,每个分区的数据量有可能会存在较大差异。

9.png

如图我们可以发现两个问题:

  1. 每个partition的数据量变小了,如果还按照之前与partition相等的task个数去处理当前数据,有点浪费task的计算资源;
  2. 每个partition的数据量不一样,会导致后面的每个task处理每个partition数据的时候,每个task要处理的数据量不同,这很有可能导致数据倾斜问题。

如图所示,第二个分区的数据过滤后只剩100条,而第三个分区的数据过滤后剩下800条,在相同的处理逻辑下,第二个分区对应的task处理的数据量与第三个分区对应的task处理的数据量差距达到了8倍,这也会导致运行速度可能存在数倍的差距,这也就是数据倾斜问题。

针对上述的两个问题,我们分别进行分析:

  1. 针对第一个问题,既然分区的数据量变小了,我们希望可以对分区数据进行重新分配,比如将原来4个分区的数据转化到2个分区中,这样只需要用后面的两个task进行处理即可,避免了资源的浪费。

  2. 针对第二个问题,解决方法和第一个问题的解决方法非常相似,对分区数据重新分配,让每个partition中的数据量差不多,这就避免了数据倾斜问题。

那么具体应该如何实现上面的解决思路?我们需要coalesce算子。
repartition与coalesce都可以用来进行重分区,其中repartition只是coalesce接口中shuffle为true的简易实现,coalesce默认情况下不进行shuffle,但是可以通过参数进行设置。

假设我们希望将原本的分区个数A通过重新分区变为B,那么有以下几种情况:

  1. A > B(多数分区合并为少数分区)
    ① A与B相差值不大
    此时使用coalesce即可,无需shuffle过程。
    ② A与B相差值很大
    此时可以使用coalesce并且不启用shuffle过程,但是会导致合并过程性能低下,所以推荐设置coalesce的第二个参数为true,即启动shuffle过程。

  2. A < B(少数分区分解为多数分区)
    此时使用repartition即可,如果使用coalesce需要将shuffle设置为true,否则coalesce无效。

我们可以在filter操作之后,使用coalesce算子针对每个partition的数据量各不相同的情况,压缩partition的数量,而且让每个partition的数据量尽量均匀紧凑,以便于后面的task进行计算操作,在某种程度上能够在一定程度上提升性能。

注意:local模式是进程内模拟集群运行,已经对并行度和分区数量有了一定的内部优化,因此不用去设置并行度和分区数量。

4. repartition解决SparkSQL低并行度问题

常规性能调优中我们讲解了并行度的调节策略,但是,并行度的设置对于Spark SQL是不生效的,用户设置的并行度只对于Spark SQL以外的所有Spark的stage生效。

Spark SQL的并行度不允许用户自己指定,Spark SQL自己会默认根据hive表对应的HDFS文件的split个数自动设置Spark SQL所在的那个stage的并行度,用户自己通spark.default.parallelism参数指定的并行度,只会在没Spark SQL的stage中生效。

由于Spark SQL所在stage的并行度无法手动设置,如果数据量较大,并且此stage中后续的transformation操作有着复杂的业务逻辑,而Spark SQL自动设置的task数量很少,这就意味着每个task要处理为数不少的数据量,然后还要执行非常复杂的处理逻辑,这就可能表现为第一个有Spark SQL的stage速度很慢,而后续的没有Spark SQL的stage运行速度非常快。

为了解决Spark SQL无法设置并行度和task数量的问题,我们可以使用repartition算子。

Spark SQL这一步的并行度和task数量肯定是没有办法去改变了,但是,对于Spark SQL查询出来的RDD,立即使用repartition算子,去重新进行分区,这样可以重新分区为多个partition,从repartition之后的RDD操作,由于不再设计Spark SQL,因此stage的并行度就会等于你手动设置的值,这样就避免了Spark SQL所在的stage只能用少量的task去处理大量数据并执行复杂的算法逻辑。

5. reduceByKey本地聚合

reduceByKey相较于普通的shuffle操作一个显著的特点就是会进行map端的本地聚合,map端会先对本地的数据进行combine操作,然后将数据写入给下个stage的每个task创建的文件中,也就是在map端,对每一个key对应的value,执行reduceByKey算子函数。

reduceByKey算子的执行过程如下:


10.png

使用reduceByKey对性能的提升如下:
1.本地聚合后,在map端的数据量变少,减少了磁盘IO,也减少了对磁盘空间的占用;
2.本地聚合后,下一个stage拉取的数据量变少,减少了网络传输的数据量;
3.本地聚合后,在reduce端进行数据缓存的内存占用减少;
4.本地聚合后,在reduce端进行聚合的数据量减少。
基于reduceByKey的本地聚合特征,我们应该考虑使用reduceByKey代替其他的shuffle算子。比如groupByKey。

Shuffle调优

1. 调节map端缓冲区大小

在Spark任务运行过程中,如果shuffle的map端处理的数据量比较大,但是map端缓冲的大小是固定的,可能会出现map端缓冲数据频繁spill溢写到磁盘文件中的情况,使得性能非常低下,通过调节map端缓冲的大小,可以避免频繁的磁盘IO操作,进而提升Spark任务的整体性能。

map端缓冲的默认配置是32KB,如果每个task处理640KB的数据,那么会发生640/32 = 20次溢写,如果每个task处理64000KB的数据,机会发生64000/32=2000此溢写,这对于性能的影响是非常严重的。

map端缓冲的配置方法:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.shuffle.file.buffer", "64")

2. 调节reduce端拉取数据缓冲区大小

Spark Shuffle过程中,shuffle reduce task的buffer缓冲区大小决定了reduce task每次能够缓冲的数据量,也就是每次能够拉取的数据量,如果内存资源较为充足,适当增加拉取数据缓冲区的大小,可以减少拉取数据的次数,也就可以减少网络传输的次数,进而提升性能。

reduce端数据拉取缓冲区的大小可以通过spark.reducer.maxSizeInFlight参数进行设置,默认为48MB,该参数的设置方法:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.reducer.maxSizeInFlight", "96")

3. 调节reduce端拉取数据重试次数

Spark Shuffle过程中,reduce task拉取属于自己的数据时,如果因为网络异常等原因导致失败会自动进行重试。对于那些包含了特别耗时的shuffle操作的作业,建议增加重试最大次数(比如60次),以避免由于JVM的full gc或者网络不稳定等因素导致的数据拉取失败。在实践中发现,对于针对超大数据量(数十亿~上百亿)的shuffle过程,调节该参数可以大幅度提升稳定性。

reduce端拉取数据重试次数可以通过spark.shuffle.io.maxRetries参数进行设置,该参数就代表了可以重试的最大次数。如果在指定次数之内拉取还是没有成功,就可能会导致作业执行失败,默认为3.

该参数的设置方法:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.shuffle.io.maxRetries", "6")

4. 调节reduce端拉取数据等待间隔

Spark Shuffle过程中,reduce task拉取属于自己的数据时,如果因为网络异常等原因导致失败会自动进行重试,在一次失败后,会等待一定的时间间隔再进行重试,可以通过加大间隔时长(比如60s),以增加shuffle操作的稳定性。

reduce端拉取数据等待间隔可以通过spark.shuffle.io.retryWait参数进行设置,默认值为5s。

该参数的设置方法:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.shuffle.io.retryWait", "60s")

5. 调节SortShuffle排序操作阈值

对于SortShuffleManager,如果shuffle reduce task的数量小于某一阈值则shuffle write过程中不会进行排序操作,而是直接按照未经优化的HashShuffleManager的方式去写数据,但是最后会将每个task产生的所有临时磁盘文件都合并成一个文件,并会创建单独的索引文件。

当你使用SortShuffleManager时,如果的确不需要排序操作,那么建议将这个参数调大一些,大于shuffle read task的数量,那么此时map-side就不会进行排序了,减少了排序的性能开销,但是这种方式下,依然会产生大量的磁盘文件,因此shuffle write性能有待提高。

SortShuffleManager排序操作阈值的设置可以通过spark.shuffle.sort. bypassMergeThreshold这一参数进行设置,默认值为200。

该参数的设置方法:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold", "400")

JVM调优

1. 降低cache操作的内存占比

1). 静态内存管理机制

根据Spark静态内存管理机制,堆内存被划分为了两块,Storage和Execution。Storage主要用于缓存RDD数据和broadcast数据,Execution主要用于缓存在shuffle过程中产生的中间数据,Storage占系统内存的60%,Execution占系统内存的20%,并且两者完全独立。

在一般情况下,Storage的内存都提供给了cache操作,但是如果在某些情况下cache操作内存不是很紧张,而task的算子中创建的对象很多,Execution内存又相对较小,这回导致频繁的minor gc,甚至于频繁的full gc,进而导致Spark频繁的停止工作,性能影响会很大。

在Spark UI中可以查看每个stage的运行情况,包括每个task的运行时间、gc时间等等,如果发现gc太频繁,时间太长,就可以考虑调节Storage的内存占比,让task执行算子函数式,有更多的内存可以使用。

Storage内存区域可以通过spark.storage.memoryFraction参数进行指定,默认为0.6,即60%,可以逐级向下递减。

内存占比设置:

val conf = new SparkConf()
  .set("spark.storage.memoryFraction", "0.4")

2). 统一内存管理机制

根据Spark统一内存管理机制,堆内存被划分为了两块,Storage和Execution。Storage主要用于缓存数据,Execution主要用于缓存在shuffle过程中产生的中间数据,两者所组成的内存部分称为统一内存,Storage和Execution各占统一内存的50%,由于动态占用机制的实现,shuffle过程需要的内存过大时,会自动占用Storage的内存区域,因此无需手动进行调节。

2. 调节Executor堆外内存

Executor的堆外内存主要用于程序的共享库、Perm Space、 线程Stack和一些Memory mapping等, 或者类C方式allocate object。

有时,如果你的Spark作业处理的数据量非常大,达到几亿的数据量,此时运行Spark作业会时不时地报错,例如shuffle output file cannot find,executor lost,task lost,out of memory等,这可能是Executor的堆外内存不太够用,导致Executor在运行的过程中内存溢出。

stage的task在运行的时候,可能要从一些Executor中去拉取shuffle map output文件,但是Executor可能已经由于内存溢出挂掉了,其关联的BlockManager也没有了,这就可能会报出shuffle output file cannot find,executor lost,task lost,out of memory等错误,此时,就可以考虑调节一下Executor的堆外内存,也就可以避免报错,与此同时,堆外内存调节的比较大的时候,对于性能来讲,也会带来一定的提升。

默认情况下,Executor堆外内存上限大概为300多MB,在实际的生产环境下,对海量数据进行处理的时候,这里都会出现问题,导致Spark作业反复崩溃,无法运行,此时就会去调节这个参数,到至少1G,甚至于2G、4G。

Executor堆外内存的配置需要在spark-submit脚本里配置:

--conf spark.yarn.executor.memoryOverhead=2048

以上参数配置完成后,会避免掉某些JVM OOM的异常问题,同时,可以提升整体Spark作业的性能。

3. 调节连接等待时长

在Spark作业运行过程中,Executor优先从自己本地关联的BlockManager中获取某份数据,如果本地BlockManager没有的话,会通过TransferService远程连接其他节点上Executor的BlockManager来获取数据。

如果task在运行过程中创建大量对象或者创建的对象较大,会占用大量的内存,这回导致频繁的垃圾回收,但是垃圾回收会导致工作现场全部停止,也就是说,垃圾回收一旦执行,Spark的Executor进程就会停止工作,无法提供相应,此时,由于没有响应,无法建立网络连接,会导致网络连接超时。

在生产环境下,有时会遇到file not found、file lost这类错误,在这种情况下,很有可能是Executor的BlockManager在拉取数据的时候,无法建立连接,然后超过默认的连接等待时长60s后,宣告数据拉取失败,如果反复尝试都拉取不到数据,可能会导致Spark作业的崩溃。这种情况也可能会导致DAGScheduler反复提交几次stage,TaskScheduler返回提交几次task,大大延长了我们的Spark作业的运行时间。

连接等待时长需要在spark-submit脚本中进行设置:

--conf spark.core.connection.ack.wait.timeout=300

调节连接等待时长后,通常可以避免部分的XX文件拉取失败、XX文件lost等报错。

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