ubuntu学习_2：ubuntu中安装netcdf4教程

    最近根据导师老板的要求要学习建模系统，结果第一步就卡住了，研究了好久才明白首先要建立netcdf4的库。下面是我收集到的安装教程，以供大家学习（还有我以后电脑崩溃重装时不至于抓瞎）。

    目前，安装netcdf4以上的版本是将c和Fortran分开，也就是要先装netcdf-c才能装netcdf-fortran.

    而且在安装netcdf-c和netcdf-fortran之前还需要两个东西，一个是zlib，一个是HDF5，也就是本次教程需要安装四个软件。本次教程需要fortran的intel编译器ifort。

    根据网友们建议，几个程序都安装在同一个文件夹下，这样有一个好处，就是在编辑环境变量的时候可以有效避免漏掉一下库和链接.

本次使用安装包：

zlib-1.2.11.tar.gz

hdf5-1.8.18.tar.gz

curl-7.70.0.tar.gz

netcdf-c-4.8.0.tar.gz

netcdf-fortran-4.5.3.tar.gz

1. Fortran编译器是Intel的ifort，终端中输入：

export CC=icc
export CXX=icpc
export CFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'
export CXXFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'
export F77=ifort
export FC=ifort
export F90=ifort
export FFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'
export CPP='icc -E'
export CXXCPP='icpc -E'

2. 安装zlib

下载地址：http://www.zlib.net/    （本次教程使用zlib-1.2.11版本）

cd进入zlib所下载的文件夹后，解压 tar -zxvf zlib-1.2.11.tar.gz

进入zlib-1.2.11文件夹，配置安装信息：

./configure --prefix=/usr/local/netcdf4（usr文件夹创建是需要root或者sudo）

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

安装完成之后会在/usr/local/netcdf4这个目录下生成三个文件lib include share

#3.安装szip （本次未安装）

#下载地址：ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4/

#解压 tar -zxvf slib-2.1.tar.gz

#配置安装信息：./configure --prefix=/usr/local/netcdf4

#编译：make

#检查：make check

#安装：make install

4.安装hdf5（基本同第二步）

下载地址：https://portal.hdfgroup.org/display/support/HDF5+1.12.0#files

解压 tar -zxvf hdf5-1.8.18.tar.gz

配置安装信息.

./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --with-zlib=/usr/local/netcdf4/

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

5.安装curl  

地址: https://curl.se/download/

解压 tar -zxvf curl-7.70.0.tar.gz

配置安装信息:(选一个)

./configure --with-zlib=/usr/local/netcdf4 --prefix=/usr/local/netcdf4

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

6.安装netcdf-c

下载地址 https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/

解压 tar -zxvf netcdf-c-4.8.0.tar.gz

配置安装信息 CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --disable-dap

注：sudo apt-get install m4 (如果提示没有m4的话，否则可以不执行)

编译：make

检查：make check

安装：sudo make install

7.安装netcdf-fortran

告知库文件位置.终端中输入:

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

解压tar -zxvf netcdf-fortran-4.5.3.tar.gz

配置安装信息(选一个)

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --disable-dap

CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib ./configure --          prefix=/usr/local/netcdf4    CC=gcc FC=gfortran  #可用gfortran或ifort,要与pycnal安装一致

编译：sudo make

检查：sudo make check

安装：sudo make install

8.环境变量

bashrc中添加

终端输入：sudo gedit ~/.bashrc

打开.bashrc文件后在最后添加

export NETCDF=/usr/local/netcdf4

export PATH=$NETCDF/bin:$PATH

export CPPFLAGS=-I/usr/local/netcdf4/include

export LDFLAGS=-L/usr/local/netcdf4/lib

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4/lib:${LD_LIBRARY_PATH}

添加完成

终端运行：source ~/.bashrc

完毕

测试：ncdump

源码包相关：

        这种软件包里面都是源程序，没有编译过，经过编译后才能安装。

        需要注意的是，make编译后里面文件会发生改变，如果想要重装建议删除文件夹重新解压再编译然后配置安装信息，不然可能会报错。

        安装：

        1）先解压并切换到文件夹

            tar -zxvf ***.tar.gz

            tar -jxvf ***.tar.bz(或bz2)

        2)./configure  #配置#

        3）make #调用make#

        4)make install #安装源代码#

        5）make clean 删除安装时产生的临时文件

        卸载：

        1）进入安装时的目录

        2）make uninstall #卸载#

注意：make install命令过程中的安装目录，或者阅读安装目录里面的readme文件，当然最好的办法是在安装的过程中指定安装目录，即在/configure命令后面加参数--prefix-/**，如：./configure --prefix=/usr/local/aaaa,即把软件装在/usr/local/路径的aaaa这个目录里。一般的软件的默认安装目录在/usr/local或者/opt里，可以到那里去找找。指定安装目录以后，当我们不需要这个软件时，直接删除软件的目录就行了。

参考：https://blog.csdn.net/weixin_27256197/article/details/116863420?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2~default~baidujs_utm_term~default-0.control&spm=1001.2101.3001.4242

https://www.cnblogs.com/gabriel-sun/p/12128386.html

https://www.cnblogs.com/fsquared/p/3804863.html