【技术推文】R语言生物群落(生态)数据统计分析与绘图

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前言

生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
一:R和Rstudio简介及入门和作图基础

二:R语言数据清洗-tidyverse包应用
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三:群落数据准备及探索分析
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四:群落数据非约束排序-PCA、CA、PCoA、NMDS
 
五:群落数据约束排序-RDA、dbRDA、CCA、4th Corner
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六:群落数据分组分析: 等级/非等级聚类(HC/NHC)、PERMANOVA等
 

 
七:群落数据随机森林(Random Forest)模型-分类VS回归
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八:一般线性模型(lm)
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九:广义线性模型(glm)
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十:线性混合效应模型(lmm)
 
十二:空间、时间及系统发育相关回归-数据自相关(autocorrelation)分析
 
 
十三:结构方程模型(SEM):lavaan和piecewiseSEM-多变量直接和间接效应及因果关系
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十四:群落数据及统计分析结果作图(ggplot)、排版及发表质量图输出
 
 

 

 


 

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