2022-06-05多序列比对教程

1、格式化数据库

makeblastdb  -in  genome.pep  -dbtype  prot

2、序列比对(筛选blast最优结果)

blastp   -query   AP2.fa  -db  genome.pep  -outfmt 6 -max_hsps 1  -num_alignments 1 -out ap2.tab  -evalue 1e-5   -num_threads  8 

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