conda问题汇总

换源

conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --append channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/fastai/
conda config --append channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --append channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
	# 搜索时显示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes

InvalidVersionSpecError: Invalid version spec: =2.7

参考这篇

编辑用户目录下的.condarc ( 例如windows就是:C:\Users\admin.condarc ,Linux一般是~/.condarc

删除带有:conda-forge 的那一行即可

CondaValueError: Malformed version string ‘~‘: invalid character(s).

参考这篇

需要更新conda,管理员权限执行

sudo conda upgrade -n base conda
sudo conda upgrade -n base -c defaults --override-channels conda

即可

CondaHTTPError: HTTP 404 NOT FOUND for url http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/label/gcc7/noarch/repodata.json

这是源的问题,再换个源试试

rm ~/.condarc
conda config --remove-key channels
conda config --append channels conda-forge --append channels bioconda --append channels defaults

anaconda 和 Geant4 的冲突

编译时报错:

/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libSM.so: undefined reference to `uuid_generate@UUID_1.0'

参考这篇和这篇

尝试运行下面命令以解决,

conda install -c conda-forge xorg-libsm

或者,最简单的方法:

  1. 删除掉Anaconda自带的过期库文件
  2. 用系统的库文件替换之
export condapath=`whereis anaconda3` # ${condapath:10} 表示安装anaconda3的位置
sudo mv ${condapath:10}/lib/libuuid.so.1 ${condapath:10}/lib/back_libuuid.so.1
sudo ln -s /lib/x86_64-linux-gnu/libuuid.so.1 ${condapath:10}/lib/libuuid.so.1

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