MIMICⅣ2.2导入PostgreSQL

准备：

• MMICIV2.2数据库(https://physionet.org/content/mimiciv/2.2),只解压最外层的文件夹，里面的csv数据文件无需解压
• PostgreSQL软件
• mimiciv的sql文件(https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main)

1. 下载并安装7zip解压工具

安装好后，将安装位置写入环境变量
此电脑->右击->属性->高级系统设置->环境变量->在系统变量里找到Path->双击->新建->输入7zip安装位置->确定

环境变量设置好了后检查下是否安装成功
win+R->输入cmd->输入7z
如果一切都设置好了则会出现7zip的属性界面，类似下图

2. postgre创建数据库

打开psql的SQL Shell，一路回车直到输入密码，密码输入好后

CREATE DATABASE mimiciv OWNER postgres;#创建数据库mimiciv，用户为postgres
\c mimiciv;切换到mimiciv数据库下

3. 创建SCHEMA

CREATE SCHEMA mimiciv;
set search_path to mimiciv;

4. 创建Table

打开从GitHub上下载的mimiciv数据库代码，找到create.sql文件，一般是在mimic-code-2.4.0\mimic-iv\buildmimic\postgres这个路径下，复制create.sql的文件地址，在shell内输入 \i 地址，比如

\i R:/mimic-code-2.4.0\mimic-iv\buildmimic\postgres #E:/mimic-code-2.4.0\mimic-iv\buildmimic\postgres是我的create文件地址

5. 数据库导入

我的mimiciv2.2数据文件地址是R:\MIMICIV\mimic-iv-2.2，打开从GitHub上下载的mimiciv数据库代码，找到load_7z.sql文件，一般是在mimic-code-2.4.0\mimic-iv\buildmimic\postgres这个路径下

\set mimic_data_dir 'R:\MIMICIV\mimic-iv-2.2' #给加载数据的sql代码提供数据文件地址
\i R:/GitHub/mimic-iv/buildmimic/postgres/load_7z.sql

6. 添加索引

\i R:/mimic-code-2.4.0/mimic-iv/buildmimic/postgres/index.sql