julia与生物信息小白初体验

我最近刚尝试了julia,特别喜欢

1 速度比python快

2 语法不难,会python的话,更简单

3交互式的,有四种模式,可以随时查看帮助文档,或者切换路径,例如,在linux上,切换路径用:

cd (“path”)

而如果是python,就要

import os

os. chdir(path)

4io比python文件简单,eachline直接读取生成迭代器

5调用linux命令方便,调用python,R,perl,c也很方便,这就有点变态了,例如pycall几乎可以调用所有python包

6我学的编程语言不多,julia学起来跟python很像,还有perl的影子,内置函数丰富,熟悉perl的用户一定知道 chop 和chomp函数,用起来很方便。正则据说兼容perl,我觉得是比python正则好用点,不用导入外部的包,直接内置了re

7都说这门语言适合数据科学,那是肯定没错的,我觉得搞 生物信息 的学julia比python要好,在linux下分析数据,julia绝对更舒适,迭代的读取文件,

for i in eachline(“path/file”)

这比python 的open和with open要简便许多

8还有,难道没人觉得,这是新时代的perl吗,我觉得julia会在Linux运维的道路上占有一席之地,最起码是比python更合适的

9生态还需要继续发展

10.....+努力学习中

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