3.基于基因表达谱来确定腹主动脉的关键基因

题目: Identification of key genes associated with the human abdominal aortic aneurysm based on the gene expression profile

DOI: 10.3892/mmr.2015.4448

数据集: GSE47472

样本:

GSE47472: 14 AAA, 8 normal

分析方法:

DEG: R语言(limma, threshold: log fold change (FC)>1 and FDR≤0.01)
DAVID: GO和KEGG富集分析
Cytoscape: PPI

文章数据:

1. 数据对比归一处理

   
   
   
   

2.A和B组火山图对比

3.A和B组韦恩图，DEG在A和B组中的相关性

4.DEG热图，A组与B组有类似的分布

5.DEG富集分析

6.PPI结果

7.高度关联的clusters

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这篇文章把一个疾病组随机分为两个亚组，再进行比较，这是比较不同的点