3.基于基因表达谱来确定腹主动脉的关键基因

题目: Identification of key genes associated with the human abdominal aortic aneurysm based on the gene expression profile
DOI: 10.3892/mmr.2015.4448
数据集: GSE47472
样本:

GSE47472: 14 AAA, 8 normal

分析方法:

DEG: R语言(limma, threshold: log fold change (FC)>1 and FDR≤0.01)
DAVID: GO和KEGG富集分析
Cytoscape: PPI

文章数据:
  1. 数据对比归一处理



2.A和B组火山图对比


3.A和B组韦恩图,DEG在A和B组中的相关性


4.DEG热图,A组与B组有类似的分布


5.DEG富集分析


6.PPI结果



7.高度关联的clusters



这篇文章把一个疾病组随机分为两个亚组,再进行比较,这是比较不同的点

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