在shell脚本中切换conda环境

导读

常用的conda activate切换conda环境的方法只能在命令行中使用，放在脚本中会报错，该如何解决呢？

一、脚本中使用conda activate

vi ztest.sh

conda activate metawrap-env
conda info --envs

bash ztest.sh

凉凉

二、bing我的问题

后来bing一下，看到了一篇文章：
Can't execute conda activate from bash script

三、source ~/conda.sh解决问题

1 my path to miniconda

conda info | grep -i 'base environment'

2 尝试使用source ~/conda.sh

vi ztest.sh

source /home/cheng/miniconda2/etc/profile.d/conda.sh
conda activate metawrap-env
conda info --envs

bash ztest.sh

3 多次conda env切换也OK

vi ztest.sh

source /home/cheng/miniconda2/etc/profile.d/conda.sh
conda activate metawrap-env
conda info --envs
conda activate base
conda info --envs
conda activate python3.6
conda info --envs

bash ztest.sh