x86_64-conda-linux-gnu-cc not found

之前有一篇文章给大家介绍了如何在 rstudio-server 中切换 R 的版本,在那篇文章中不同的 R 版本是用 conda 安装的。最近在 rstudio 中使用 conda 中 的 R 时(在 rserver.conf 中配置的 R),发现会报错,报错截图如下:

x86_64-conda-linux-gnu-cc not found_第1张图片

可是在 conda 的对应目录中这个 x86_64-conda-linux-gnu-cc 是已经安装好的。更奇怪的是,这个包在 R 的交互环境中可以安装好(在终端中输入 R,然后执行相关的装包代码),而在 rstudio 中运行相应的装包代码是却会出现报错。根据报错提示可以看到导致报错的行是在 /home/txb/miniconda3/envs/r-4.2/lib/R/etc/Makeconf中的第 171 行代码。然后我去查看了第 171 行代码,好像描述的是一种编译文件的方式。

在这里插入图片描述

这里的 CC 看起来是一个变量,最后我在该文件的第 16 行找到了它,它的值是 x86_64-conda-linux-gnu-cc, 我将它改为了 x86_64-conda-linux-gnu-cc 这个文件的绝对路径,这样就不会报错 x86_64-conda-linux-gnu-cc not found 了。

修改前:

x86_64-conda-linux-gnu-cc not found_第2张图片

修改后:

在这里插入图片描述

这个报错虽然是说的 x86_64-conda-linux-gnu-cc 没找到,不过有朝一日在 rstudio-server 中安装其他 R 包时又报其他的 xx not found,而你已经使用 conda 安装了相关软件,也可以参照此法修改 Makeconf 文件

当然,出现这种情况还有一种可能,就是你本地没安装 x86_64-conda-linux-gnu-cc。如果是这样,你需要在你使用的 R 所在的 conda 虚拟环境中安装它。安装命令如下:

conda install  gcc_linux-64 
conda install  gxx_linux-64
conda install  gfortran_linux-64

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