windows 下在NCBI批量下载SRR 数据

如果在GEO数据库上一篇文章包括了多个样本，对应到多个SRR run，那么此时一个批量下载SRR 数据的命令就非常方便了。当然，关键在于，你能获得对应的SRR id 或者srr run 下载链接。那么下面的两种下载方法，能提升效率。

1. NCBI SRA 检索结果send to RunInfo

可以在SRA数据库中通过SRP检索得到所有相关的SRR 列表。

【而后可以将下载路径放入到TXT文件，通过本地安装的wget工具，设定输入文件参数，完成批量下载。注意wget工具需要与TXT文件在同一个目录。】

2. srapub+srr ID
https://sra-download.ncbi.nlm.nih.gov/srapub/SRR*****
【此命令高效之处在于，只需要提供SRR id即可，无需确定SRR run 下载链接。下载方法与上文相同，构建TXT文件，完成下载。】

下载命令：
wget -i urls.txt -O out_dir