10.终末期腹主动脉瘤的分子特性

题目:Molecular Fingerprint for Terminal Abdominal Aortic Aneurysm Disease
DOI: 10.1161/JAHA.117.006798
数据集: GSE98278
样本:

eAAA: 31
rAAA: 17

分析方法:

DEG: R((|log 2 fold change - [FC]| ≥1.5, adjusted P<0.05)
Ingenuity Pathway Analysis : 上游调控因子的分析
IHC/RT-PCR:验证差异基因

文章数据:

1.实验设计及差异基因火山图(破裂vs稳定,中等vs大)


2.标本的病人信息


3.验证的基因列表


4.破裂vs稳定AAA上调、下调差异基因列表



5.中等vs大AAA上调、下调差异基因列表



6.候选基因的在不同组的表达水平


7.验证与AAA破裂和尺寸变化相关的5个基因


8.验证与AAA size无关的候选基因表达情况


9.AAA独有的差异基因表达情况


10.IHC验证候选基因


11.破裂AAA中新生血管情况


12.上游调控因子分析结果


13.破裂AAA与HIF-1a密切相关


14.EndoMT过程中HIF-1a表达



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