5+：基于单细胞测序和转录组数据构建胰腺癌中坏死性凋亡相关的预后模型

原文公众号：一起实验网 对下述分析方法感兴趣或者没有研究思路的小伙伴，欢迎踊跃探讨！

早！今天小编和大家分析一篇2022年10月发表在《Frontiers in Immunology》（IF:5.0）期刊上的文章《A necroptosis related prognostic model of pancreatic cancer based on single cell sequencing analysis and transcriptome analysis》。作者使用单细胞测序分析和转录组分析构建了胰腺癌坏死性凋亡相关特征。本研究可为胰腺癌的诊断、治疗及预后评估提供参考。该思路同样适用于其他肿瘤的研究，有相关需求的老师欢迎联系我们。 背景&方法 背景：

胰腺癌（Pancreatic cancer, PCa）是影响人类健康最具侵略性的癌症之一。约80-85%的PCa患者在诊断时出现不可切除状态或转移。接受手术切除的PCa患者的5年生存率仅为10-25%。目前全身化疗是主要治疗方法，但生存结局往往不理想。坏死性凋亡（Necroptosis）是一种新定义的程序性细胞死亡类型。一方面，坏死性凋亡是一种癌症抑制因子，诱导癌细胞坏死性凋亡可以逆转其对细胞死亡的抵抗力。另一方面，坏死性凋亡被认为是癌症的促进剂。在此过程中释放的免疫活性物质和活性氧促进许多癌症通路的激活，参与免疫微环境的调节，促进肿瘤细胞的增殖和侵袭。因此，坏死性凋亡及其调控机制可能是PCa肿瘤免疫治疗的重要治疗靶点。

方法：

1.GEO和TCGA公共数据库获取PCa数据；

2.WGCNA用于识别与坏死性凋亡评分相关的模块；

3.Seurat包用于单细胞数据分析&