Paper_4: 转录编程决定了尤因肉瘤肿瘤内异质性（单细胞水平）

Highlights

1. 对EWSR1-FLI1基因融合导致的尤因肉瘤的细胞系进行了时间分辨的单细胞转录组测序
2. EWSR1-FLI1融合癌基因高度特异的转录特征
3. 尤因肉瘤中转录组水平异质性的来源
4. EWSR1-FLI1融合基因的活性与代谢及其他表型状态之间的相关性

Summary

EWSR1-FLI1，一种可以引起尤因肉瘤（EwS）的融合致癌基因，触发了很多信号事件，最终导致细胞发生变化。然而，遗传层面相同的EwS细胞如何产生转录编程的差异还不清楚。在这篇研究中，我们结合了来自不同细胞类型的单细胞测序数据独立成分分析，时间分辨的EWSR1-FLI1结合位点图谱、开放染色质区域图谱的模型系统，来描述与EWSR1-FLI1活性相关的动态分子过程。我们由此定义了一个非常特异和直接的增强子驱动的EWSR1-FLI1编程。在EwS肿瘤中，细胞增殖和强烈的氧化磷酸化代谢与EWSR1-FLI1活性相关。而增加低氧条件，则可以发现较高和较低的EWSR1-FLI1活性的细胞亚群。综上所述，我们的研究揭示了尤因肉瘤肿瘤内异质性的起因。