在安卓手机上并行运行Palabos程序

前言

换手机后，安卓手机就不怎么用了。经过一番调查，发现安卓手机是可以作为小服务器，搭建个人博客，当作终端使用的，甚至还可以用来跑Openfoam。跑Openfoam这个project的网址是：https://cfd.fossee.in/case-study-project/case-study-run/208
甚是有趣，由此我便实验用手机跑Palabos。

实现步骤

测试机型：小米8

软件安装

实现的原理也是比较直接，打开手机浏览器搜索Termux，去他们官网找到app安装。

命令行设置

打开之后，进入命令行
输入
$ pkg update
$ pkg upgrade
$ termux-setup-storage

更新并获取访问内存的权限。

下载Palabos

输入以下命令下载palabos软件：

$ pkg install git
$ git clone https://gitlab.com/unigespc/palabos.git

storage是获取访问内存权限之后才出现的，会链接几个手机的文件夹。本想着在download文件夹下安装palabos，后续在其他文件管理app里打开看结果。但是查了一下发现这样受权限影响，可能会运行不了，所以就没这样做。

新版本的palabos已经开始使用cmake了，相关并行和图片处理的软件包需要安装一下：
$ pkg install cmake
$ pkg install openmpi
$ pkg install imagemagick
$ pkg install libhdf5
$ pkg install openssh

安装openssh是因为termux如果没有ssh的话，openmpi会报错：the value of the mca parameter plm_rsh_agent was set to a path。

可通过下面两行查看make和clang是否安装，如果没有被安装则需要安装一下
$ clang --version
$ make --version

需要安装proot，然后输入以下代码，否则运行程序会失败，如果是单核运行会显示bad system call。
$ pkg install proot
$ termux-chroot

解决方法来源于：
https://www.bilibili.com/read/cv5220065?from=articleDetail

但是呢，这样做会报错：
CANNOT LINK EXECUTABLE “/system/bin/sh”: library “/data/data/com.termux/files/usr/lib/libtermux-exec.so” needed or dlopened by “/system/bin/sh” is not accessible for the namespace “(default)”

程序无法正常保存结果，经过查询后续需要输入unset LD_PRELOAD才可继续运行。

编译和执行程序

那么接下来就可以开始执行了程序了，我进了的是tutorial_1的build文件夹
$ cmake …
$ make

感觉make的速度不是很慢。编译完成后，输入
$ cd …
$ unset LD_PRELOAD
$ mpirun -np 4 -oversubscribe tutorial_1_1

这里如果不使用oversubscribe的话openmpi无法运行。

此时程序已正常运行，小米8的速度在4核并行运行下跑tutorial_1_1还是相当快的。后面我直接mv tmp /home/storage/downloads，然后在文件管理app上查看，效果还行。

其他

感兴趣的同学，可以通过openssh来进一步进行远程控制。