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Biobank genetic data探析(三)
想摸鱼的生信小白
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Biobankgeneticdata探析(三)——GenotypingprocessandsampleQC一.总览Category100313这类数据包含了Affymetrix做Genotypecalling的pipeline的流程信息(后续分析中可能用不到),以及样本质量控制的信息(下游分析中估计是必用了)。二.数据集描述2.1Genotypingprocess查看之后发现这部分不是很重要,毕竟
快速排序法的使用 ( 超详细图解 )
S01d13r
链表算法快速排序面试数据结构
快速排序法的使用快速排序法作为一种广受好评的排序方法,不仅仅因为它的排序效率很高,更因为它体现了分治的思想。因此许多广为人知的软件公司(BAT)的笔试面试都喜欢考,甚至在一些大大小小的考试如软考、考研中也能见到它的身影。因此熟练默写快速排序法的代码并掌握其核心思想对我们来说尤为重要。快速排序法的背景:快速排序由C.A.R.Hoare在1960年提出。它的基本思想是:通过一趟排序将要排序的数据分割成
GBase8c aes_encrypt和aes_decrypt函数
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在数据库中,aes_encrypt和aes_decrypt函数进行加解密时使用的块加密模式。GBase8c与MySQL的aes_encrypt和aes_decrypt函数区别:1、GBase8c中的初始化向量init_vector不能为空2、MySQL的加密模块block_encryption_mode为aes-128-ecb,GBase8c不支持aes-128-ecb,默认加密模块为aes-12
C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】
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C#基础-高阶-实战知识点c#开发语言特性反射自定义特性
C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】目录C#—【特性详解以及自定义特性和通过反射读取特性】介绍:特性可以用于多种用途,包括但不限于:特性的分类:特性的主要用途(举一些直观例子)1.标记代码,让框架自动处理2.数据验证(表单/模型校验)3.控制序列化行为4.生成文档(如API接口说明)5.实现AOP(面向切面编程)为什么用特性而不用其他方法?日常开发中的高频场景一句话总结常见预定义特性
Python在生物信息学中的应用:基因组学与蛋白质组学
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Python教程-基础python
摘要:本文主要介绍了Python在生物信息学中的应用,特别是在基因组学和蛋白质组学领域。文章详细讲述了各个原理,并以代码实例展示了实际应用。我们将探讨如何利用Python分析基因组数据,解析蛋白质序列,以及进行比对分析等。文章目录1.引言2.分析基因组数据2.1读取和解析FASTA文件2.2基因频率分析2.3代码实例3.蛋白质组学3.1解析蛋白质序列3.2蛋白质序列比对3.3代码实例4.总结1.引
yaml常见的读取和写入
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allow_unicode=True:遇到中文不转换为unicode编码sort_keys=False:不进行排序,默认按照字母abcd排序importyamldefwrite_yaml_template():"""统一的yaml模板:return:"""yaml_template=[{'feature':None,'story':None,'title':None,'request':{'met
队列在计算机系统中的应用
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队列在计算机系统中有广泛的应用,主要用于管理任务和处理数据流。以下是队列的一些常见应用场景:1.任务调度操作系统:操作系统使用队列管理进程调度,如先来先服务(FCFS)调度算法。线程池:线程池通过队列管理待执行任务,确保任务按顺序处理。2.数据缓冲I/O操作:队列用于缓冲输入输出数据,平衡生产者和消费者速度。网络通信:网络数据包通过队列缓冲,确保按顺序处理。3.消息传递消息队列:在分布式系统中,消
Leetcode32 最长有效括号深度解析
八股文领域大手子
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问题描述找出字符串s中最长的有效括号子串的长度。核心思路动态规划:定义dp[i]为以字符s[i]结尾的最长有效括号子串长度。分情况讨论:根据当前字符是否为)以及前面的字符情况,推导状态转移方程。状态转移方程详解Case1:当前字符)与前一个字符(直接匹配场景:形如...()的结构。转移方程:if(s.charAt(i-1)=='('){dp[i]=dp[i-2]+2;//前i-2个字符的有效长度+
锁的策略)
康kang
synchronized锁的分类
一、锁的分类第一组:乐观锁和悲观锁这是两种不同的锁的实现方式。乐观锁:在加锁之前,预估当前出现锁冲突的概率不大,因此在进行加锁的时候就不会做太多的工作。悲观锁:在加锁之前,预估到当前锁冲突出现的概率比较大,因此加锁的时候就会做更多的工作,做的事情更多,加锁的速度可能会更慢,但整个过程中不容易出现其他问题。第二组:轻量级锁和重量级锁轻量级锁:加锁的开销小,加锁的速度更快=>一般为乐观锁重量级锁:加锁
request+pytest根据yaml文件发送请求
等枝桠~成繁花
pytest
request怎么跟pytest结合起来,然后根据yaml文件去发一个基本的请求呢?下面是一个简单的示例。1、先新建一个名为“demo.yaml”的yaml文件,用来存放测试数据的。-name:G广州研发中心parentid:1#第一次用例的数据正常expect:60008#对请求结果进行断言-name:""parentid:1#第二次用例的数据name为空expect:40058#对请求结果进行
实战篇:GBase 8a MPP Cluster 安装部署过程
Lucifer三思而后行
DBA实战系列数据库gbasecluster
目录前言☀️环境准备安装介质下载操作系统安装安装前准备1、关闭防火墙2、禁用Selinux3、创建gbase用户4、创建目录并授权5、重启主机❤️GBase8aMPPCluster安装主节点上传安装介质主节点解压安装包分发配置文件配置环境变量修改主节点安装配置文件主节点执行安装命令检查集群状态申请和导入授权①导出集群各节点的指纹信息②邮件申请授权③主节点导入授权④检查授权情况所有节点启动集群服务主
Spring Boot项目中集成sa-token实现认证授权和OAuth 2.0第三方登录
山高自有客行路
#Springbootspringboot
OAuth2.0第三方登录OAuth2.0是一种授权协议,允许第三方应用在不暴露用户密码的情况下访问用户的资源。它通常用于第三方登录场景,例如使用GitHub、Google等社交平台进行登录。在sa-token框架中,OAuth2.0第三方登录可以通过集成sa-token-oauth2模块来实现,并且可以结合sa-token的安全特性来增强安全性。导入依赖首先,在你的pom.xml文件中添加必要的
C语言中的结构体指针
812503533
c语言算法开发语言
一、什么是结构体指针?在C语言中,结构体是一种用户自定义的数据类型,可以将不同类型的变量组合在一起形成一个更复杂的数据结构。而结构体指针则是指向结构体变量地址的指针。通过结构体指针,我们可以动态访问结构体成员、传递结构体到函数以及进行内存管理等操作。结构体指针提供了一个更加灵活和高效的方式来操作结构体,特别是在处理大型数据结构时,指针的使用可以节省内存并提高程序性能。二、如何声明结构体指针?结构体
40岁重启人生学python,今天搞明白了,啥是循环结构?
飞哥知行录
中年人python经验分享开发语言
今天学习了循环结构,其实说心里话,不是太明白,尤其是老师讲了那些高深的理论之后,就更加糊涂了。后来还是借助deepseek,它说:循环结构就是让计算机重复执行某段代码,直到满足特定条件(比如吃饱了就停止吃饭)。吃饱了就停止吃饭,多么简单的一句话,我一下就明白了,忽然觉得那些讲课喜欢高深理论的人,他们真的好可悲。总是抱着概念和教条的东西,不知道你们是怎么听明白的。循环结构的三种常见类型是`for循环
一份C#的笔试题及答案
网际游侠
c#面试笔试
C#笔试题一、基础知识OOP的基本概念面向对象编程的核心思想包括四个主要特性:继承、多态、封装和信息隐藏。请简述这四个特性的具体内容。值类型与引用类型的区别值类型(如int,string)在内存中直接存储数据,而引用类型(如object,ref)通过引用间接存储,指出值的位置。请举例说明两者的不同。静态与非静态关键字的作用静态和非静态关键字用于区分依赖于实例还是不依赖于实例的成员。请分别解释它们的
Lumberyard:Lumberyard物理系统详解_2024-07-13_20-00-57.Tex
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Lumberyard:Lumberyard物理系统详解Lumberyard物理系统概述物理引擎介绍Lumberyard,亚马逊的游戏引擎,集成了强大的物理引擎,用于模拟游戏世界中的真实物理行为。其物理引擎基于PhysX,一个由NVIDIA开发的物理模拟技术,广泛应用于游戏开发中。PhysX支持复杂的物理交互,包括刚体动力学、软体物理、流体动力学等,能够为游戏提供逼真的物理效果。物理系统在Lumbe
数据结构-稀疏矩阵-十字链表存储
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当矩阵的非零元个数与位置在操作中变化较大时,就不宜用顺序存储结构来表示三元组的线性表。在链表中,每个非零元可用一个含5个域的结点表示,其中i,j,e这三个域分别表示该非零元所在的行的值,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元,向右域right用以链接同一行中下一个非零元,向下域down用以链接同一列中下一个非零元。同一行的非零元通过right域链接
Spring Boot拦截器(Interceptor)与过滤器(Filter)深度解析:区别、实现与实战指南
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SpringBoot拦截器(Interceptor)与过滤器(Filter)深度解析:区别、实现与实战指南一、核心概念对比1.本质区别维度过滤器(Filter)拦截器(Interceptor)规范层级Servlet规范(J2EE标准)SpringMVC框架机制作用范围所有请求(包括静态资源)只处理Controller请求依赖关系不依赖Spring容器完全集成SpringIOC容器执行顺序最先执行(
GBASE 8C——SQL参考6 sql语法(14)
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sql数据库
ROLLBACKPREPARED功能描述取消一个先前为两阶段提交准备好的事务。语法格式ROLLBACKPREPAREDtransaction_id参数说明transaction_id:待提交事务的标识符。它不能和任何当前预备事务已经使用了的标识符同名。注意事项要想回滚一个预备事务,必须是最初发起事务的用户,或者是系统管理员。pg_prepared_xacts系统视图中列出了当前可用的所有准备好的事
安装数据库首次应用
Array_06
javaoraclesql
可是为什么再一次失败之后就变成直接跳过那个要求
enter full pathname of java.exe的界面
这个java.exe是你的Oracle 11g安装目录中例如:【F:\app\chen\product\11.2.0\dbhome_1\jdk\jre\bin】下的java.exe 。不是你的电脑安装的java jdk下的java.exe!
注意第一次,使用SQL D
Weblogic Server Console密码修改和遗忘解决方法
bijian1013
Welogic
在工作中一同事将Weblogic的console的密码忘记了,通过网上查询资料解决,实践整理了一下。
一.修改Console密码
打开weblogic控制台,安全领域 --> myrealm -->&n
IllegalStateException: Cannot forward a response that is already committed
Cwind
javaServlets
对于初学者来说,一个常见的误解是:当调用 forward() 或者 sendRedirect() 时控制流将会自动跳出原函数。标题所示错误通常是基于此误解而引起的。 示例代码:
protected void doPost() {
if (someCondition) {
sendRedirect();
}
forward(); // Thi
基于流的装饰设计模式
木zi_鸣
设计模式
当想要对已有类的对象进行功能增强时,可以定义一个类,将已有对象传入,基于已有的功能,并提供加强功能。
自定义的类成为装饰类
模仿BufferedReader,对Reader进行包装,体现装饰设计模式
装饰类通常会通过构造方法接受被装饰的对象,并基于被装饰的对象功能,提供更强的功能。
装饰模式比继承灵活,避免继承臃肿,降低了类与类之间的关系
装饰类因为增强已有对象,具备的功能该
Linux中的uniq命令
被触发
linux
Linux命令uniq的作用是过滤重复部分显示文件内容,这个命令读取输入文件,并比较相邻的行。在正常情 况下,第二个及以后更多个重复行将被删去,行比较是根据所用字符集的排序序列进行的。该命令加工后的结果写到输出文件中。输入文件和输出文件必须不同。如 果输入文件用“- ”表示,则从标准输入读取。
AD:
uniq [选项] 文件
说明:这个命令读取输入文件,并比较相邻的行。在正常情况下,第二个
正则表达式Pattern
肆无忌惮_
Pattern
正则表达式是符合一定规则的表达式,用来专门操作字符串,对字符创进行匹配,切割,替换,获取。
例如,我们需要对QQ号码格式进行检验
规则是长度6~12位 不能0开头 只能是数字,我们可以一位一位进行比较,利用parseLong进行判断,或者是用正则表达式来匹配[1-9][0-9]{4,14} 或者 [1-9]\d{4,14}
&nbs
Oracle高级查询之OVER (PARTITION BY ..)
知了ing
oraclesql
一、rank()/dense_rank() over(partition by ...order by ...)
现在客户有这样一个需求,查询每个部门工资最高的雇员的信息,相信有一定oracle应用知识的同学都能写出下面的SQL语句:
select e.ename, e.job, e.sal, e.deptno
from scott.emp e,
(se
Python调试
矮蛋蛋
pythonpdb
原文地址:
http://blog.csdn.net/xuyuefei1988/article/details/19399137
1、下面网上收罗的资料初学者应该够用了,但对比IBM的Python 代码调试技巧:
IBM:包括 pdb 模块、利用 PyDev 和 Eclipse 集成进行调试、PyCharm 以及 Debug 日志进行调试:
http://www.ibm.com/d
webservice传递自定义对象时函数为空,以及boolean不对应的问题
alleni123
webservice
今天在客户端调用方法
NodeStatus status=iservice.getNodeStatus().
结果NodeStatus的属性都是null。
进行debug之后,发现服务器端返回的确实是有值的对象。
后来发现原来是因为在客户端,NodeStatus的setter全部被我删除了。
本来是因为逻辑上不需要在客户端使用setter, 结果改了之后竟然不能获取带属性值的
java如何干掉指针,又如何巧妙的通过引用来操作指针————>说的就是java指针
百合不是茶
C语言的强大在于可以直接操作指针的地址,通过改变指针的地址指向来达到更改地址的目的,又是由于c语言的指针过于强大,初学者很难掌握, java的出现解决了c,c++中指针的问题 java将指针封装在底层,开发人员是不能够去操作指针的地址,但是可以通过引用来间接的操作:
定义一个指针p来指向a的地址(&是地址符号):
Eclipse打不开,提示“An error has occurred.See the log file ***/.log”
bijian1013
eclipse
打开eclipse工作目录的\.metadata\.log文件,发现如下错误:
!ENTRY org.eclipse.osgi 4 0 2012-09-10 09:28:57.139
!MESSAGE Application error
!STACK 1
java.lang.NoClassDefFoundError: org/eclipse/core/resources/IContai
spring aop实例annotation方法实现
bijian1013
javaspringAOPannotation
在spring aop实例中我们通过配置xml文件来实现AOP,这里学习使用annotation来实现,使用annotation其实就是指明具体的aspect,pointcut和advice。1.申明一个切面(用一个类来实现)在这个切面里,包括了advice和pointcut
AdviceMethods.jav
[Velocity一]Velocity语法基础入门
bit1129
velocity
用户和开发人员参考文档
http://velocity.apache.org/engine/releases/velocity-1.7/developer-guide.html
注释
1.行级注释##
2.多行注释#* *#
变量定义
使用$开头的字符串是变量定义,例如$var1, $var2,
赋值
使用#set为变量赋值,例
【Kafka十一】关于Kafka的副本管理
bit1129
kafka
1. 关于request.required.acks
request.required.acks控制者Producer写请求的什么时候可以确认写成功,默认是0,
0表示即不进行确认即返回。
1表示Leader写成功即返回,此时还没有进行写数据同步到其它Follower Partition中
-1表示根据指定的最少Partition确认后才返回,这个在
Th
lua统计nginx内部变量数据
ronin47
lua nginx 统计
server {
listen 80;
server_name photo.domain.com;
location /{set $str $uri;
content_by_lua '
local url = ngx.var.uri
local res = ngx.location.capture(
java-11.二叉树中节点的最大距离
bylijinnan
java
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;
public class MaxLenInBinTree {
/*
a. 1
/ \
2 3
/ \ / \
4 5 6 7
max=4 pass "root"
Netty源码学习-ReadTimeoutHandler
bylijinnan
javanetty
ReadTimeoutHandler的实现思路:
开启一个定时任务,如果在指定时间内没有接收到消息,则抛出ReadTimeoutException
这个异常的捕获,在开发中,交给跟在ReadTimeoutHandler后面的ChannelHandler,例如
private final ChannelHandler timeoutHandler =
new ReadTim
jquery验证上传文件样式及大小(好用)
cngolon
文件上传jquery验证
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<script src="jquery1.8/jquery-1.8.0.
浏览器兼容【转】
cuishikuan
css浏览器IE
浏览器兼容问题一:不同浏览器的标签默认的外补丁和内补丁不同
问题症状:随便写几个标签,不加样式控制的情况下,各自的margin 和padding差异较大。
碰到频率:100%
解决方案:CSS里 *{margin:0;padding:0;}
备注:这个是最常见的也是最易解决的一个浏览器兼容性问题,几乎所有的CSS文件开头都会用通配符*来设
Shell特殊变量:Shell $0, $#, $*, $@, $?, $$和命令行参数
daizj
shell$#$?特殊变量
前面已经讲到,变量名只能包含数字、字母和下划线,因为某些包含其他字符的变量有特殊含义,这样的变量被称为特殊变量。例如,$ 表示当前Shell进程的ID,即pid,看下面的代码:
$echo $$
运行结果
29949
特殊变量列表 变量 含义 $0 当前脚本的文件名 $n 传递给脚本或函数的参数。n 是一个数字,表示第几个参数。例如,第一个
程序设计KISS 原则-------KEEP IT SIMPLE, STUPID!
dcj3sjt126com
unix
翻到一本书,讲到编程一般原则是kiss:Keep It Simple, Stupid.对这个原则深有体会,其实不仅编程如此,而且系统架构也是如此。
KEEP IT SIMPLE, STUPID! 编写只做一件事情,并且要做好的程序;编写可以在一起工作的程序,编写处理文本流的程序,因为这是通用的接口。这就是UNIX哲学.所有的哲学真 正的浓缩为一个铁一样的定律,高明的工程师的神圣的“KISS 原
android Activity间List传值
dcj3sjt126com
Activity
第一个Activity:
import java.util.ArrayList;import java.util.HashMap;import java.util.List;import java.util.Map;import android.app.Activity;import android.content.Intent;import android.os.Bundle;import a
tomcat 设置java虚拟机内存
eksliang
tomcat 内存设置
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2117772
http://eksliang.iteye.com/
常见的内存溢出有以下两种:
java.lang.OutOfMemoryError: PermGen space
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
------------
Android 数据库事务处理
gqdy365
android
使用SQLiteDatabase的beginTransaction()方法可以开启一个事务,程序执行到endTransaction() 方法时会检查事务的标志是否为成功,如果程序执行到endTransaction()之前调用了setTransactionSuccessful() 方法设置事务的标志为成功则提交事务,如果没有调用setTransactionSuccessful() 方法则回滚事务。事
Java 打开浏览器
hw1287789687
打开网址open浏览器open browser打开url打开浏览器
使用java 语言如何打开浏览器呢?
我们先研究下在cmd窗口中,如何打开网址
使用IE 打开
D:\software\bin>cmd /c start iexplore http://hw1287789687.iteye.com/blog/2153709
使用火狐打开
D:\software\bin>cmd /c start firefox http://hw1287789
ReplaceGoogleCDN:将 Google CDN 替换为国内的 Chrome 插件
justjavac
chromeGooglegoogle apichrome插件
Chrome Web Store 安装地址: https://chrome.google.com/webstore/detail/replace-google-cdn/kpampjmfiopfpkkepbllemkibefkiice
由于众所周知的原因,只需替换一个域名就可以继续使用Google提供的前端公共库了。 同样,通过script标记引用这些资源,让网站访问速度瞬间提速吧
进程VS.线程
m635674608
线程
资料来源:
http://www.liaoxuefeng.com/wiki/001374738125095c955c1e6d8bb493182103fac9270762a000/001397567993007df355a3394da48f0bf14960f0c78753f000 1、Apache最早就是采用多进程模式 2、IIS服务器默认采用多线程模式 3、多进程优缺点 优点:
多进程模式最大
Linux下安装MemCached
字符串
memcached
前提准备:1. MemCached目前最新版本为:1.4.22,可以从官网下载到。2. MemCached依赖libevent,因此在安装MemCached之前需要先安装libevent。2.1 运行下面命令,查看系统是否已安装libevent。[root@SecurityCheck ~]# rpm -qa|grep libevent libevent-headers-1.4.13-4.el6.n
java设计模式之--jdk动态代理(实现aop编程)
Supanccy2013
javaDAO设计模式AOP
与静态代理类对照的是动态代理类,动态代理类的字节码在程序运行时由Java反射机制动态生成,无需程序员手工编写它的源代码。动态代理类不仅简化了编程工作,而且提高了软件系统的可扩展性,因为Java 反射机制可以生成任意类型的动态代理类。java.lang.reflect 包中的Proxy类和InvocationHandler 接口提供了生成动态代理类的能力。
&
Spring 4.2新特性-对java8默认方法(default method)定义Bean的支持
wiselyman
spring 4
2.1 默认方法(default method)
java8引入了一个default medthod;
用来扩展已有的接口,在对已有接口的使用不产生任何影响的情况下,添加扩展
使用default关键字
Spring 4.2支持加载在默认方法里声明的bean
2.2
将要被声明成bean的类
public class DemoService {