孟德尔随机化 LDSC基因评分

LDSC基因评分

一、什么是LDSC
LDSC（LD Score regression）是一种常用的遗传相关性分析方法，用于估计复杂性疾病和复杂性特征的遗传贡献。基于遗传连锁不平衡（LD）的概念，通过估计每个SNP的LD Score来推断其与复杂性状之间的关联强度。

LD Score是一种衡量SNP与周围SNP之间LD关联程度的统计量。
LD Score的计算基于两个因素：SNP对之间的遗传相关性（r）和SNP对之间的物理距离（d）。LD Score可以通过以下公式计算：
LD Score = r * d
其本质是一个线性回归的公式。

LDSC的结果通常包括遗传相关性估计、遗传相关性的标准误差和遗传相关性的p值等信息。
需要注意的是，解释LDSC的结果时，应该将其视为关联性证据，并不能确定因果关系。因此，在解释LDSC结果时，需要谨慎考虑其他可能的解释和因果关系的证据。
总之，要查看LDSC的结果，可以关注遗传相关性估计、标准误差、p值以及其他相关的结果，以了解遗传贡献的大小、可靠性和统计显著性。这些结果可以帮助我们理解复杂性疾病和复杂性特征的遗传基础。

也可以查看油管，the University of Colorado Boulder 科罗拉多大学的讲解