Spark TaskAttempt目录未删除问题排查

https://blog.csdn.net/u013332124/article/details/98356924

一、问题描述

有业务反馈spark任务结束后会遗留一些attempt目录在输出目录上,影响数据的读取。主要现象如下:

在这里插入图片描述

二、问题分析

之前排查过一个类似的问题,也是输出目录下有个遗留的_temporary目录未删除干净:

Spark 任务输出目录_temporary目录未删除问题排查

一开始以为就是这个问题,但是仔细分析了下,发现逻辑走不通。因此仔细做了下排查。

从目录的名称结构来看,我们很容易的可以看出这些都是spark task输出的临时目录,比如attempt_20190801042010_1478_r_000970_1则表示对应的RddId为1478,处理partitionId为970的task的第2次运行(开启推测执行后,spark会自动启动更多的task运行,这个数值从0开始累加,第一次运行就是0)。另外需要注意的是,这里的RddId并不等于stageId。

具体spark job是怎么输出临时目录并最终合并到输出目录的可以参考下这个文档:

Spark任务输出文件过程详解

既然知道是task输出的临时目录的问题,就可以找一个task去跟踪他的执行了。我们找了attempt_20190801042010_1478_r_000970_1这个task根据他的执行情况。最后跟到了partitonId=970这个task的两次运行记录所在的executor,看了下日志,发现以下两条关键日志:

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

从上面的日志可以看出,970这个task的两次attempt几乎在同时完成,时间都是04:20:37,364。也就是说他们执行commitTask的动作几乎是同时的。因此我们可以看一下FileOutputCommitter的commitTask方法:

public void commitTask(TaskAttemptContext context, Path taskAttemptPath)
throws IOException {
  TaskAttemptID attemptId = context.getTaskAttemptID();
  //判断该task是否需要输出
  if (hasOutputPath()) {
    context.progress();
    if(taskAttemptPath == null) {
      taskAttemptPath = getTaskAttemptPath(context);
    }
    Path committedTaskPath = getCommittedTaskPath(context);
    FileSystem fs = taskAttemptPath.getFileSystem(context.getConfiguration());
    //判断该task的attempt目录是否存在
    if (fs.exists(taskAttemptPath)) {
      //判断之前是否有其他attempt的task已经提交过
      if(fs.exists(committedTaskPath)) {
        if(!fs.delete(committedTaskPath, true)) {
          throw new IOException("Could not delete " + committedTaskPath);
        }
      }
      //执行rename,将 attempt_20190801042010_1478_r_000970_1 重命名成 task_20190801042010_1478_r_000970
      if(!fs.rename(taskAttemptPath, committedTaskPath)) {
        throw new IOException("Could not rename " + taskAttemptPath + " to "
            + committedTaskPath);
      }
        //输出日志,也就是我们刚才看到的那两条日志
      LOG.info("Saved output of task '" + attemptId + "' to " +
          committedTaskPath);
    } else {
      LOG.warn("No Output found for " + attemptId);
    }
  } else {
    LOG.warn("Output Path is null in commitTask()");
  }
}

这段代码的主要流程就是在task attempt执行完后,将attempt目录rename成commitedTask目录,这样就标志着这个task已经完成了。

但是我们可以看出,这个代码并没有做同步,假设同时有两个task attempt一起执行该方法,最差的情况就是两个线程都同时执行了 fs.rename(taskAttemptPath, committedTaskPath)。那么同时执行rename会有什么问题呢?

其实rename就是linux上的mv,逻辑基本是一样的。mv的逻辑是这样的,如果目标路径不存在,直接rename过去,修改一下文件的元数据就好了。如果目标路径已存在,则会将source文件移动目录路径下

所以如果两个task attempt同时执行commitTask的rename,则会出现task970的输出目录task_20190801042010_1478_r_000970下有两个文件:

part-r-00970
attempt_20190801042010_1478_r_000970_1

最终spark在job结束后会统一将所有task输出目录下的所有文件都移动到输出目录下,因此才有了我们看到的现象。

三、总结

这个问题主要还是spark在处理推测执行的task时没处理好并发问题,目前可以想到的两种解决方案如下:

1、 在FileOutputCommitter的commitTask方法中加锁避免并发问题,这个需要修改hadoop的代码。但是如果不是对spark和hadoop的所有代码都很熟悉,不建议这么改,因为可能会引发其他的问题

2、 关闭推测执行,一劳永逸。目前发现了许多由于推测执行引发的问题(spark版本2.1.0),说明这一特性还不是很成熟,可以先关了(部分任务确实需要的话可以自行开启)

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