在VS Code中使用Jupyter运行R
文章参考：https://www.practicaldatascience.org/html/jupyter_r_notebooks.html
Jupyter的理念是将工作的界面与进行分析的底层编程语言分开。这使得创建一个界面（一个文本编辑器，一个显示结果的窗口等）成为可能，该界面可以用来在任何数量的不同程序中运行你的分析。在Jupyter生态系统中，被用来实际运行你的分析的程序（如Python、R）被称为kernel。
这意味着，可以将Jupyter笔记本用于Python之外的其他用途。
首先需要安装：
- Visual Studio Code
- python
- R
Install Jupyter with miniconda
在VS Code中使用jupyter笔记本，可以通过安装插件实现，但VS Code只是使用了一个小版本的jupyter，与编辑器捆绑在一起。不过，要设置R与Jupyter笔记本一起工作，我们必须进行真正的jupyter安装。
安装miniconda:
- 下载 Miniconda sh 文件，链接如下
https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html#macosx-installers
国内网络可用进入清华镜像下载https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
选择对应的版本，m1/m2芯片对应的是arm64，Intel芯片则是bit-x86 - 在终端中安装, 执行如下命令
# 进入文件所在路径
cd /Users/julie/code/
#读取路径中的文件
sh Miniconda3-latest-MacOSX-arm64.sh
cd ..#返回上一级目录
- 会弹出一个软件协议条款让你阅读，这时候直接按下Ctrl+C便可以跳过阅读过程，直接按照提示，输入yes，然后按回车键，同意软件协议条款。
- 继续按回车，安装好后会提示：Thank you for installing Miniconda3!
设置conda环境
- 重启终端（Terminal）应用程序；输入
vim ~/.zshrc，按回车键进入编辑模式 - 将光标移动到最后一行，在其中添加
export PATH=/Users/julie/miniconda3/bin:$PATH - 按下Esc键退出插入模式；
- 输入
:wq保存修改并退出vim编辑器； - 输入
source ~/.zshrc使更改的环境变量生效。
注：如果使用的 shell 是 bash，则需要修改.bash_profile文件。 - 重启终端，通过检查版本来查看是否安装成功
conda -V
如果出现了版本号则安装成功
安装Jupyter
在终端中运行：
conda install jupyter
Setting Up R with Jupyter
- 在终端（zsh）键入
R进入
（如果不能通过键入“R”直接进入，则可输入R安装的绝对路径：/Applications/R.app/Contents/MacOS/R）
获取方法：应用程序 > R > 单击右键 > 显示包内容 > Contents > MacOS > R - 运行：
install.packages("IRkernel")
- 安装完成后，在R中运行：
IRkernel::installspec()
然后我遇到了如下的问题：
> IRkernel::installspec()
Error in IRkernel::installspec() :
jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 127.
In addition: Warning message:
In system2("jupyter", c("kernelspec", "--version"), FALSE, FALSE) :
error in running command
这意味着R找不到安装的jupyter。请确保：(a)按照上面的指示安装了jupyter，(b)使用设置环境中的指示。（我后面重新操作了一下设置conda环境那一步，再次安装就成功啦）。
- 然后打开VS Code，新建一个Jupyter notebook文件，就可以选择r内核啦！！！