RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具-学习笔记

这篇文章算是对下面若干篇主要参考资料的补充。也是本人在经历四个下午之后终于完成的第一步的一点记录。

• 之前我用cufflink系列进行了一次RNA-seq分析，这一次是在学习了一种新的分析方法。在整个过程中，也参照了一些生信宝典公众号（这真的对于生信小白来说很nice，强烈推荐）的许多知识。

• conda的安装与使用（2019-6-28更新）

• conda 安装RNA-Seq所需软件

• RNA-seq基础入门传送门 （生信宝典团队）

• 强烈安利的RNA-seq教程
  具体流程看上面几个链接就足够了。

• 大概讲一下，我这次安装软件遇到的一些问题和感悟。

1.我下载了多个miniconda，有2 ，有3，两者有什么不同，我没深究。但是，采用下面代码在Linux下载，没有问题，但是安装总是安装不上，起初怀疑是网络问题，因为蹭隔壁邻居家的，后来心痛开了热点，发现还是这样，解压不完全，卡在了30-80%的进度条上。果断放弃，回到了清华镜像网站上，换成了miniconda3- 4.5.12版本，一切恢复到正常。这就是今天一下午干的活。

 wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
 bash  Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
 source /home/leo/miniconda3/bin/activate #激活base

conda create -n python2 python=