Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布

很多ImageJ/Fiji的问题用中文查不到,尽早尝试用英文去搜索!!!!!!!!

下面记录两个小功能,以及英文教程和imageJ写脚本的教程。

调整图像对比度

  • Step1:打开一张图像。比如我的一个tif图特别暗,就可以调一调对比度
    Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第1张图片

  • Step2:调整对比度
    使用快捷键:Ctrl+Shift+C
    或者:Image—>Adjust —>Brightness/ContrastFiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第2张图片
    得到下面这个调节框,然后一般点击Auto就可以了,也可手调Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第3张图片

查看图像的像素直方图分布

Step1:打开一张图像。我还以上面那个图为例子。
Step2: 快捷键:Ctrl+H
或者: Analyze—>Histogram
Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第4张图片
Step3:就得到下图的像素直方图分布啦。
Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第5张图片
可以看到最大像素值11056,最小值为0一共有8750000个像素。

注意:在调整对比度后,Histogram不会有变化,像素值的最大最小值没有差异!

Fiji/ImageJ可用详细教程推荐

  1. 一个非常棒的教你用python写Fiji脚本的教程,虽然用的python2.7但是问题不大
    https://syn.mrc-lmb.cam.ac.uk/acardona/fiji-tutorial/#iterating-pixels
    Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布_第6张图片

  2. ImageJ使用说明
    https://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-29.html

  3. 一个fiji教程
    https://learning.rc.virginia.edu/notes/fiji-intro/

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