不用linux转录组数据分析,无参考基因组的转录组测序分析流程

下边上干货.

1. 分析流程：

 

2. 分析步骤

2.1 数据预处理，质控过程，与有参考的转录组分析一致

 

2.2 UniGene拼接目的：将预处理后reads进行拼接，得到拼接结果。

原理： 应用 de Bruijn graph path 算法对reads进行denovo拼接；对

上一步的拼接结果，再用Hamilton Path算法拼接。

结果：UniGene序列，UniGene统计信息，序列长度分布图

 

2.3 数据库注释

目的：对拼接得到的UniGene进行功能注释

原理：通过blast+算法将拼接得到的UniGene序列与数据库进行比对

结果：比对结果表格，物种分布统计