甲基化-全基因组甲基化测序WGBS & RRBS

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    表观基因组中 5mC(DNA 甲基化) 概述:在甲基转移酶的作用下,DNA 序列中的胞嘧啶(C) 5`碳位结合一个甲基基团形成5`-甲基胞嘧啶的现象。

DNA甲基化检测技术包括:基于Bisulfite转化的检测技术、基于限制性内切酶的检测技术、基于免疫共沉淀的检测技术。


基于Bisulfite转化的检测技术

    通过亚硫酸氢盐将基因组中未发生甲基化C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,而有甲基化修饰的C碱基则不发生改变。#这样便将具有甲基化修饰的C碱基与不具有甲基化修饰的C碱基区分开来。再结合高通量测序技术,得到单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。


全基因组甲基化测序(whole genome bisulfiite sequencing : WGBS-SEQ)

    全基因组甲基化测序技术通过T4-DNA连接酶,在超声波打断基因组DNA片段的两端连接接头序列,连接产物通过重亚硫酸盐处理将未甲基化修饰的胞嘧啶C转变为Uraci lU,进而通过接头序列介导的 PCR 技术将Uracil U转变为胸腺嘧啶T。WGBS是甲基化测序的”金标准”。


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