Error: package or namespace load failed for ‘hdf5r’ in dyn.load libhdf5_hl.so.100

zhongle@gxun-2288H-V5:~/test_R/evalu_models$ locate libhdf5_hl.so.100

/home/zhongle/anaconda3/lib/libhdf5_hl.so.100

/home/zhongle/anaconda3/lib/libhdf5_hl.so.100.1.3

/home/zhongle/anaconda3/pkgs/hdf5-1.10.6-hb1b8bf9_0/lib/libhdf5_hl.so.100

/home/zhongle/anaconda3/pkgs/hdf5-1.10.6-hb1b8bf9_0/lib/libhdf5_hl.so.100.1.3

在~/.Rprofile中添加路径,没有的用conda安装hdf5

/home/zhongle/anaconda3/pkgs/hdf5-1.10.6-hb1b8bf9_0/lib/libhdf5_hl.so.100

vim ~/.Rprofile

添加:

dyn.load('/home/zhongle/anaconda3/pkgs/hdf5-1.10.6-hb1b8bf9_0/lib/libhdf5_hl.so.100')

:wq!保存退出

即可完成安装

详见

R 包 hdf5r 安装出错 - 组学大讲堂问答社区

                                                                                          

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