【影像组学入门百问】#12----#21

#12-什么是rad-score,怎么计算?

很多朋友问起这个概念,也跟一些朋友讨论过,自己也查过文献,没有找到原始文献,不知道确切概念是什么。
但根据文献内容看,rad-score一般认为是任何线性模型特征的加权和,也有研究是纳入了临床指标的加权和。
有了解的朋友欢迎补充、指正!

#13-pyradiomics安装和使用的“坑”

使用python进行影像组学特征提取,请安装pyradiomics,注意拼写,注意不是radiomics。但在使用时,导入的包为 radiomics,即 import radiomics

#14-python3.8安装pyradiomics常规问题——无法卸载’ruamel-yaml’

安装pyradiomics时,无法卸载某其他库?

可能是系统中存在多个版本或多个相关文件。
可先通过pip -V,确定库安装位置。再手动进入库进行删除。

#15-应该先做重采样还是先勾画感兴趣区?

应该先做重采样还是先勾画感兴趣区?
重采样之后画感兴趣区一般会更准确,但大多重采样都会增加影像层数,增加勾画感兴趣区的工作量,且重采样之前勾画的感兴趣区也会相应地进行“重采样”,因此先勾画感兴趣区,再进行重采样是可以的。

#16-两类样本数据量相差较大怎么办?

可以借助算法进行权重分配或进行数据合成。

#17-不同方法特征筛选后,保留的特征数不同,但分类效果类似,应该怎么取舍?*

奥卡姆剃刀原则,如无必要勿增实体。根据需要,在特征数目和效果之间做一个大约的折中。

注:该回答来自人工智能专家,

网名:AwarenessWater(allaboutmywife)

#18-通过某些软件画roi后,其他软件打开影像文件和mask文件错位?**

通过某些软件(例如3d slicer)画roi后,其他软件打开影像文件和mask文件错位。
问题所在:有些软件勾画roi保存后,仅保存了roi部分数据而不是全部数据,因此可能存在其他软件打开出错问题。可通过代码重建roi文件。

#19-使用pyradiomics库进行影像组学特征提取时,提示数据类型错误。*

使用pyradiomics库进行影像组学特征提取时,提示数据类型错误。
解决方法:通过代码重建类型错误的文件,一般可改为Int8类型数据。

#20-windows系统安装python库的时候报错(EnvironmentError)*

windows系统安装python库的时候报错:
“ERROR: Could not install packages due to an EnvironmentError: [WinError 5] 拒绝访问。”
解决方法:以管理员身份打开命令提示符。

#21-使用pyradiomics库进行影像组学特征提

取时,提示维度不一致的错误。

解决方法:通过代码重建影像和mask文件,统一维度。

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