QuPath病理流程学习 ③ IHC、H&E (WSI的处理)实战

示例数据

示例样本获取,里面有HE和IHC两种切片数据

Hamamatsu NDPI (cmu.edu)

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Cell detection — QuPath 0.5.0 documentation

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在QuPath中,病理选择Brightfield H&E和Brightfield DAB代表了不同的染色方式。H&E代表了Hematoxylin and Eosin(苏木精和伊红)染色技术,而DAB代表了3,3'-Diaminobenzidine(二氨基苯基丁二酮)染色技术。 H&E染色是最常用的组织染色技术之一,它使用苏木精染色细胞核(呈蓝色)和伊红染色细胞质(呈粉红色)。这种染色方法可以帮助生物学家和病理学家观察和鉴定组织中的细胞类型、结构和形态学特征。 DAB染色是一种常用的免疫组织化学染色方法,它使用DAB作为显色剂。在免疫组织化学实验中,抗体与组织中的特定抗原结合后,通过添加DAB显色产生棕色或棕黑色的反应产物。这种染色方法可用于检测和定位组织中的特定分子或抗原。 因此,H&E病理切片和DAB病理切片在染色上有明显的差异。H&E病理切片呈现出细胞核为蓝色,细胞质为粉红色的特征,而DAB病理切片呈现出棕色或棕黑色的显色结果。这些差异使得研究人员能够利用不同的染色方式来观察和分析组织中的不同结构和分子,从而更好地理解生物学和疾病机制。

多重分析使用的文件:

Index of /images/Vectra-QPTIFF/perkinelmer/PKI_fields (openmicroscopy.org)


流程导图

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参考:

1 - Introduction to QuPath for IHC analysis_哔哩哔哩_bilibili

Quantitative Pathology & BioImage Analysis_ QuPath - [NEUBIASAcademy@Home] Webin_哔哩哔哩_bilibili

Projects — QuPath 0.5.0 documentation

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