本地安装GitHub上面的R包没有NAMESPACE处理

1. 目的

  最近从GitHub上安装一个叫FlexDotPlot的R包，结果需要R版本大于等于3.6.3，但是本地没有，只有3.6.1的，想着这个差别不大，因此将FlexDotPlot包改了一下配置，可以安装，结果用devtools::install_github安装老是报错：

报错

2. 解决办法

  遇到这个问题，也百度了很多方法，发现之前有人遇到过类似的问题，被install_github吐槽版本低不给通过安装该怎么办这篇文章就有介绍以及如何解决，这个其实就是install_github太过敏感了，把warnning给转成错误，所以导致安装失败，如果本地源代码安装就不会出现此问题。

install.packages("FlexDotPlot/", repos = NULL, type = "source")

3. GitHub源代码安装

  在GitHub上面下载FlexDotPlot的源代码，然后进行安装，结果又出现报错，如下报错：

第二次出现报错

  原来是R包的源代码必须有一个NAMESPACE文件，结果这里没有，因此出现报错，遇山开路，遇河搭桥，既然遇到了问题，那就解决这个问题，这个问题最后也是通过网上查询知道了解决方案， Stack Overflow上具有人遇到过此类问题，而且也给了解决方案。只需要再生成一个NAMESPACE文件即可。

 echo 'exportPattern( "." )' > NAMESPACE

  然后再通过源代码安装，在这里，除了一些警告信息，就没有其他的问题，重要解决了。

 install.packages("FlexDotPlot/", repos = NULL, type = "source")

警告信息

  在这里出现了很多的警告信息，比如之前遇到的gridExtra需要R version 3.6.3版本，而且不止一个包，还有很多其他的一些包，都有此问题，不过这里只是一个警告信息。到了这里，FlexDotPlot包已经安装完成，没有其他问题，不过这个过程，给了我们一个提示，有时候devtools::install_github出现报错的问题，可以通过源代码来安装，devtools::install_github比源代码对警告信息更为敏感。

4. FlexDotPlot

  FlexDotPlot包是什么，有什么作用，以有时间再记录，这就是一个单细胞转录组画图的包，这里我就放几个图，以后有时间在写使用记录文档。

# Reduce dendrogramm sizes (default widths/heights = c(1,5))

image.png

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2020年11月23日