linux 小技巧（随时更新）linux tips

最近更新2020.12.29

使用linux 时一些常用的小命令，每次都要去查太费劲，所以把自己常用的命令总结出来

1. 查看cpu核心、内存大小、硬盘使用情况

1. cpu 核心

   nproc --all
   #24
   grep 'processor' /proc/cpuinfo | sort -u | wc -l
   #24
   

2. 内存大小

free -mh
#              total        used        free      shared  buff/cache   available
#Mem:           125G        527M         50G        9.3M         74G        124G
#Swap:          121G          0B        121G

3. 硬盘使用情况

 df -h
#Filesystem      Size  Used Avail Use% Mounted on
#udev             63G     0   63G   0% /dev
#tmpfs            13G  9.3M   13G   1% /run
#/dev/sdb3       3.5T  2.4T  940G  73% /
#tmpfs            63G     0   63G   0% /dev/shm
#tmpfs           5.0M     0  5.0M   0% /run/lock
#tmpfs            63G     0   63G   0% /sys/fs/cgroup
#/dev/sdb1       922M   57M  802M   7% /boot
#tmpfs            13G     0   13G   0% /run/user/1002

2. 软连接

某些软件使用并没有使用conda安装，可以手动make之后把常用软件（如sra-tools里的fasterq-dump）软连接到已经在.bashrc 中加入环境变量的文件夹中，然后就可以使用了。

这里有坑！！要使用软件的绝对路径，否则后续很可能报错！

ln -s /home/where/your/software /where/the/softlinkIn/.bashrc
source ~/.bashrc

3. 压缩（打包）/解压缩

# 压缩
gzip zipfile 
#-r 递归目录压缩，但是每个文件单独压缩 

pigz zipfile -p threads 
#可以多线程压缩，速度快 -k 处理后不要删除原始文件，-r 递归目录压缩，但是每个文件单独压缩 

# 打包
tar -czf all.tar.gz *.fastaq
#-c create 建立新的备份文件

# 解压缩
unpigz -p threads  # 可以多线程解压缩
tar - xvzf zipfile
#解压缩 -x 从压缩的文件中提取文件,-z 支持gzip解压文件,-v 显示操作过程,-f 指定压缩文件

4. 使用Winscp连接 VM VirtualBox

设置为桥接网卡

image-20201229214528285.png

#关闭防火墙
sudo ufw disable
#安装server
apt-get install openssh-server
#开启sshd
service sshd start
#查看IP
ifconfig

image-20201229214946751.png