生信技能树团队推出-aspera下载fastq数据终极工具

生信技能树团队推出-aspera下载fastq数据终极工具

现在把这个技巧分享给大家，让我们的讲师助教团队总结了经验如下：
国内从NCBI下载高通测序数据时候，由于数据量比较大，下载速度是个瓶颈，高速下载软件Aspera可以批量下载SRA文件，但是不总是高速，还会遇到各种问题，可以参看前面的推文：
安装Aspera Connect工具下载sra数据

为了更好的解决国内下载数据的痛点，生信技能树团推出了生信技能树团推出-aspera下载fastq数据终极工具，使用aspera从EBI下载fastq数据，抛弃NCBI的SRA数据库吧！
就像文章的所说的，这个是国内下载NGS数据的终极解决办法：

前面我们大量NGS相关教程视频免费发布在B站，都是使用NCBI的SRA数据库下载sra文件后转为fastq进行NGS分析流程，其实是因为我本人一直不在中国大陆，所以没有网络问题。但是学生们不一样，同样的命令他们prefetch的下载比蜗牛还慢，即使加上aspera后也会面临sra文件转为fastq的限速。所以我们在全国巡讲的答疑群给大家指点的解决方案是使用aspera从EBI下载直接fastq数据，一劳永逸。

参考

使用aspera从EBI下载fastq数据，抛弃NCBI的SRA数据库吧！

安装Aspera Connect工具下载sra数据